Protein–RNA interactions for Protein: B9EKI3

Tmf1, TATA element modulatory factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmf1B9EKI3 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmf1B9EKI3 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmf1B9EKI3 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmf1B9EKI3 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmf1B9EKI3 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmf1B9EKI3 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmf1B9EKI3 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmf1B9EKI3 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmf1B9EKI3 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmf1B9EKI3 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmf1B9EKI3 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmf1B9EKI3 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmf1B9EKI3 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmf1B9EKI3 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmf1B9EKI3 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmf1B9EKI3 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmf1B9EKI3 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmf1B9EKI3 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmf1B9EKI3 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmf1B9EKI3 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmf1B9EKI3 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmf1B9EKI3 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmf1B9EKI3 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmf1B9EKI3 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmf1B9EKI3 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmf1B9EKI3 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmf1B9EKI3 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmf1B9EKI3 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmf1B9EKI3 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmf1B9EKI3 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmf1B9EKI3 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmf1B9EKI3 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmf1B9EKI3 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmf1B9EKI3 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmf1B9EKI3 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmf1B9EKI3 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmf1B9EKI3 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmf1B9EKI3 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmf1B9EKI3 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmf1B9EKI3 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmf1B9EKI3 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmf1B9EKI3 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmf1B9EKI3 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmf1B9EKI3 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmf1B9EKI3 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmf1B9EKI3 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmf1B9EKI3 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmf1B9EKI3 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmf1B9EKI3 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmf1B9EKI3 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmf1B9EKI3 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmf1B9EKI3 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmf1B9EKI3 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmf1B9EKI3 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmf1B9EKI3 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmf1B9EKI3 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmf1B9EKI3 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmf1B9EKI3 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmf1B9EKI3 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmf1B9EKI3 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmf1B9EKI3 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmf1B9EKI3 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmf1B9EKI3 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmf1B9EKI3 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmf1B9EKI3 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmf1B9EKI3 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmf1B9EKI3 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmf1B9EKI3 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
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Tmf1B9EKI3 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmf1B9EKI3 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmf1B9EKI3 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmf1B9EKI3 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmf1B9EKI3 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmf1B9EKI3 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmf1B9EKI3 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmf1B9EKI3 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmf1B9EKI3 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmf1B9EKI3 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmf1B9EKI3 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmf1B9EKI3 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmf1B9EKI3 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmf1B9EKI3 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmf1B9EKI3 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmf1B9EKI3 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmf1B9EKI3 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmf1B9EKI3 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmf1B9EKI3 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmf1B9EKI3 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmf1B9EKI3 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmf1B9EKI3 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmf1B9EKI3 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmf1B9EKI3 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmf1B9EKI3 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmf1B9EKI3 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmf1B9EKI3 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmf1B9EKI3 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmf1B9EKI3 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmf1B9EKI3 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmf1B9EKI3 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms