Protein–RNA interactions for Protein: B2RW38

Cfap58, Cilia- and flagella-associated protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap58B2RW38 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cfap58B2RW38 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cfap58B2RW38 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cfap58B2RW38 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cfap58B2RW38 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cfap58B2RW38 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cfap58B2RW38 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cfap58B2RW38 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cfap58B2RW38 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cfap58B2RW38 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cfap58B2RW38 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cfap58B2RW38 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cfap58B2RW38 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cfap58B2RW38 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cfap58B2RW38 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cfap58B2RW38 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cfap58B2RW38 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cfap58B2RW38 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cfap58B2RW38 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cfap58B2RW38 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cfap58B2RW38 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cfap58B2RW38 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cfap58B2RW38 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cfap58B2RW38 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cfap58B2RW38 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cfap58B2RW38 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cfap58B2RW38 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cfap58B2RW38 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cfap58B2RW38 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cfap58B2RW38 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cfap58B2RW38 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cfap58B2RW38 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cfap58B2RW38 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cfap58B2RW38 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cfap58B2RW38 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cfap58B2RW38 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cfap58B2RW38 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cfap58B2RW38 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cfap58B2RW38 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Cfap58B2RW38 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cfap58B2RW38 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cfap58B2RW38 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cfap58B2RW38 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cfap58B2RW38 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cfap58B2RW38 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cfap58B2RW38 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cfap58B2RW38 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cfap58B2RW38 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cfap58B2RW38 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cfap58B2RW38 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cfap58B2RW38 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cfap58B2RW38 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cfap58B2RW38 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cfap58B2RW38 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cfap58B2RW38 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cfap58B2RW38 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cfap58B2RW38 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cfap58B2RW38 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cfap58B2RW38 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cfap58B2RW38 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cfap58B2RW38 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cfap58B2RW38 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Cfap58B2RW38 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Cfap58B2RW38 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cfap58B2RW38 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cfap58B2RW38 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cfap58B2RW38 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cfap58B2RW38 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cfap58B2RW38 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cfap58B2RW38 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cfap58B2RW38 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cfap58B2RW38 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cfap58B2RW38 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cfap58B2RW38 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cfap58B2RW38 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cfap58B2RW38 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cfap58B2RW38 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cfap58B2RW38 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cfap58B2RW38 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cfap58B2RW38 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cfap58B2RW38 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cfap58B2RW38 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Cfap58B2RW38 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cfap58B2RW38 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cfap58B2RW38 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cfap58B2RW38 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cfap58B2RW38 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cfap58B2RW38 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cfap58B2RW38 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cfap58B2RW38 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cfap58B2RW38 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cfap58B2RW38 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cfap58B2RW38 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cfap58B2RW38 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cfap58B2RW38 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cfap58B2RW38 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cfap58B2RW38 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cfap58B2RW38 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cfap58B2RW38 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cfap58B2RW38 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms