Protein–RNA interactions for Protein: B2RTN3

Zscan5b, Zinc finger and SCAN domain-containing 5B, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zscan5bB2RTN3 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zscan5bB2RTN3 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zscan5bB2RTN3 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Zscan5bB2RTN3 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zscan5bB2RTN3 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zscan5bB2RTN3 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zscan5bB2RTN3 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zscan5bB2RTN3 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zscan5bB2RTN3 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zscan5bB2RTN3 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zscan5bB2RTN3 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zscan5bB2RTN3 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zscan5bB2RTN3 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zscan5bB2RTN3 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zscan5bB2RTN3 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zscan5bB2RTN3 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zscan5bB2RTN3 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zscan5bB2RTN3 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zscan5bB2RTN3 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zscan5bB2RTN3 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Zscan5bB2RTN3 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zscan5bB2RTN3 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zscan5bB2RTN3 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zscan5bB2RTN3 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zscan5bB2RTN3 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zscan5bB2RTN3 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zscan5bB2RTN3 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zscan5bB2RTN3 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zscan5bB2RTN3 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zscan5bB2RTN3 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zscan5bB2RTN3 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zscan5bB2RTN3 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zscan5bB2RTN3 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zscan5bB2RTN3 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zscan5bB2RTN3 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Zscan5bB2RTN3 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zscan5bB2RTN3 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Zscan5bB2RTN3 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zscan5bB2RTN3 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zscan5bB2RTN3 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zscan5bB2RTN3 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zscan5bB2RTN3 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zscan5bB2RTN3 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Zscan5bB2RTN3 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zscan5bB2RTN3 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zscan5bB2RTN3 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zscan5bB2RTN3 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zscan5bB2RTN3 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zscan5bB2RTN3 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zscan5bB2RTN3 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zscan5bB2RTN3 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zscan5bB2RTN3 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zscan5bB2RTN3 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zscan5bB2RTN3 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zscan5bB2RTN3 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zscan5bB2RTN3 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zscan5bB2RTN3 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zscan5bB2RTN3 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zscan5bB2RTN3 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zscan5bB2RTN3 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zscan5bB2RTN3 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Zscan5bB2RTN3 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zscan5bB2RTN3 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zscan5bB2RTN3 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zscan5bB2RTN3 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zscan5bB2RTN3 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zscan5bB2RTN3 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zscan5bB2RTN3 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zscan5bB2RTN3 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zscan5bB2RTN3 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zscan5bB2RTN3 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zscan5bB2RTN3 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zscan5bB2RTN3 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zscan5bB2RTN3 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zscan5bB2RTN3 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zscan5bB2RTN3 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Zscan5bB2RTN3 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Zscan5bB2RTN3 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Zscan5bB2RTN3 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zscan5bB2RTN3 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zscan5bB2RTN3 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zscan5bB2RTN3 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zscan5bB2RTN3 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Zscan5bB2RTN3 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zscan5bB2RTN3 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zscan5bB2RTN3 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zscan5bB2RTN3 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zscan5bB2RTN3 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Zscan5bB2RTN3 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Zscan5bB2RTN3 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Zscan5bB2RTN3 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Zscan5bB2RTN3 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Zscan5bB2RTN3 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Zscan5bB2RTN3 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zscan5bB2RTN3 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zscan5bB2RTN3 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zscan5bB2RTN3 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Zscan5bB2RTN3 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zscan5bB2RTN3 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zscan5bB2RTN3 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms