Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Brpf1B2RRD7 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Brpf1B2RRD7 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Brpf1B2RRD7 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Brpf1B2RRD7 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Brpf1B2RRD7 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Brpf1B2RRD7 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Brpf1B2RRD7 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Brpf1B2RRD7 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Brpf1B2RRD7 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Brpf1B2RRD7 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Brpf1B2RRD7 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Brpf1B2RRD7 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Brpf1B2RRD7 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Brpf1B2RRD7 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Brpf1B2RRD7 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Brpf1B2RRD7 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Brpf1B2RRD7 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Brpf1B2RRD7 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Brpf1B2RRD7 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Brpf1B2RRD7 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Brpf1B2RRD7 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Brpf1B2RRD7 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Brpf1B2RRD7 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Brpf1B2RRD7 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Brpf1B2RRD7 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Brpf1B2RRD7 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Brpf1B2RRD7 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Brpf1B2RRD7 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Brpf1B2RRD7 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Brpf1B2RRD7 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Brpf1B2RRD7 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Brpf1B2RRD7 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Brpf1B2RRD7 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Brpf1B2RRD7 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Brpf1B2RRD7 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Brpf1B2RRD7 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Brpf1B2RRD7 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Brpf1B2RRD7 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Brpf1B2RRD7 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Brpf1B2RRD7 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Brpf1B2RRD7 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Brpf1B2RRD7 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Brpf1B2RRD7 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Brpf1B2RRD7 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Brpf1B2RRD7 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Brpf1B2RRD7 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Brpf1B2RRD7 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Brpf1B2RRD7 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Brpf1B2RRD7 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Brpf1B2RRD7 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Brpf1B2RRD7 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Brpf1B2RRD7 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Brpf1B2RRD7 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Brpf1B2RRD7 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Brpf1B2RRD7 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Brpf1B2RRD7 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Brpf1B2RRD7 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Brpf1B2RRD7 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Brpf1B2RRD7 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Brpf1B2RRD7 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Brpf1B2RRD7 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Brpf1B2RRD7 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Brpf1B2RRD7 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Brpf1B2RRD7 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Brpf1B2RRD7 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Brpf1B2RRD7 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Brpf1B2RRD7 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Brpf1B2RRD7 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Brpf1B2RRD7 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Brpf1B2RRD7 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Brpf1B2RRD7 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Brpf1B2RRD7 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Brpf1B2RRD7 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Brpf1B2RRD7 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Brpf1B2RRD7 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Brpf1B2RRD7 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Brpf1B2RRD7 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Brpf1B2RRD7 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Brpf1B2RRD7 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Brpf1B2RRD7 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Brpf1B2RRD7 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Brpf1B2RRD7 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Brpf1B2RRD7 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Brpf1B2RRD7 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Brpf1B2RRD7 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Brpf1B2RRD7 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Brpf1B2RRD7 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Brpf1B2RRD7 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Brpf1B2RRD7 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Brpf1B2RRD7 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Brpf1B2RRD7 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Brpf1B2RRD7 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Brpf1B2RRD7 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Brpf1B2RRD7 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Brpf1B2RRD7 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Brpf1B2RRD7 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Brpf1B2RRD7 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Brpf1B2RRD7 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Brpf1B2RRD7 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms