Protein–RNA interactions for Protein: B1AUF7

1700042G07Rik, MCG1049117, mousemouse

Predictions only

Length 90 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700042G07RikB1AUF7 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
1700042G07RikB1AUF7 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
1700042G07RikB1AUF7 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
1700042G07RikB1AUF7 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
1700042G07RikB1AUF7 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
1700042G07RikB1AUF7 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
1700042G07RikB1AUF7 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
1700042G07RikB1AUF7 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
1700042G07RikB1AUF7 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
1700042G07RikB1AUF7 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
1700042G07RikB1AUF7 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
1700042G07RikB1AUF7 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
1700042G07RikB1AUF7 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
1700042G07RikB1AUF7 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
1700042G07RikB1AUF7 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
1700042G07RikB1AUF7 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
1700042G07RikB1AUF7 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
1700042G07RikB1AUF7 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
1700042G07RikB1AUF7 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
1700042G07RikB1AUF7 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
1700042G07RikB1AUF7 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
1700042G07RikB1AUF7 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
1700042G07RikB1AUF7 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
1700042G07RikB1AUF7 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
1700042G07RikB1AUF7 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
1700042G07RikB1AUF7 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
1700042G07RikB1AUF7 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
1700042G07RikB1AUF7 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
1700042G07RikB1AUF7 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
1700042G07RikB1AUF7 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
1700042G07RikB1AUF7 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
1700042G07RikB1AUF7 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
1700042G07RikB1AUF7 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
1700042G07RikB1AUF7 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
1700042G07RikB1AUF7 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
1700042G07RikB1AUF7 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
1700042G07RikB1AUF7 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
1700042G07RikB1AUF7 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC8.41□□□□□ -1.06
1700042G07RikB1AUF7 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
1700042G07RikB1AUF7 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
1700042G07RikB1AUF7 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
1700042G07RikB1AUF7 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
1700042G07RikB1AUF7 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.41□□□□□ -1.06
1700042G07RikB1AUF7 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
1700042G07RikB1AUF7 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
1700042G07RikB1AUF7 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
1700042G07RikB1AUF7 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
1700042G07RikB1AUF7 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
1700042G07RikB1AUF7 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
1700042G07RikB1AUF7 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
1700042G07RikB1AUF7 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
1700042G07RikB1AUF7 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC8.41□□□□□ -1.06
1700042G07RikB1AUF7 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
1700042G07RikB1AUF7 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
1700042G07RikB1AUF7 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
1700042G07RikB1AUF7 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
1700042G07RikB1AUF7 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
1700042G07RikB1AUF7 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
1700042G07RikB1AUF7 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
1700042G07RikB1AUF7 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
1700042G07RikB1AUF7 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.41□□□□□ -1.06
1700042G07RikB1AUF7 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
1700042G07RikB1AUF7 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
1700042G07RikB1AUF7 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
1700042G07RikB1AUF7 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
1700042G07RikB1AUF7 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
1700042G07RikB1AUF7 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.4□□□□□ -1.06
1700042G07RikB1AUF7 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
1700042G07RikB1AUF7 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
1700042G07RikB1AUF7 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
1700042G07RikB1AUF7 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
1700042G07RikB1AUF7 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
1700042G07RikB1AUF7 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
1700042G07RikB1AUF7 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
1700042G07RikB1AUF7 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
1700042G07RikB1AUF7 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
1700042G07RikB1AUF7 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
1700042G07RikB1AUF7 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
1700042G07RikB1AUF7 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
1700042G07RikB1AUF7 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
1700042G07RikB1AUF7 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
1700042G07RikB1AUF7 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
1700042G07RikB1AUF7 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
1700042G07RikB1AUF7 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
1700042G07RikB1AUF7 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
1700042G07RikB1AUF7 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
1700042G07RikB1AUF7 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
1700042G07RikB1AUF7 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
1700042G07RikB1AUF7 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
1700042G07RikB1AUF7 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC8.4□□□□□ -1.06
1700042G07RikB1AUF7 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
1700042G07RikB1AUF7 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
1700042G07RikB1AUF7 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
1700042G07RikB1AUF7 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
1700042G07RikB1AUF7 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
1700042G07RikB1AUF7 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC8.4□□□□□ -1.06
1700042G07RikB1AUF7 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
1700042G07RikB1AUF7 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
1700042G07RikB1AUF7 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
1700042G07RikB1AUF7 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms