Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Grik3B1AS29 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Grik3B1AS29 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Grik3B1AS29 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Grik3B1AS29 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Grik3B1AS29 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Grik3B1AS29 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Grik3B1AS29 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Grik3B1AS29 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Grik3B1AS29 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Grik3B1AS29 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Grik3B1AS29 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Grik3B1AS29 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Grik3B1AS29 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Grik3B1AS29 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Grik3B1AS29 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Grik3B1AS29 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Grik3B1AS29 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Grik3B1AS29 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Grik3B1AS29 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Grik3B1AS29 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Grik3B1AS29 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Grik3B1AS29 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Grik3B1AS29 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Grik3B1AS29 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Grik3B1AS29 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Grik3B1AS29 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Grik3B1AS29 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Grik3B1AS29 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Grik3B1AS29 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Grik3B1AS29 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Grik3B1AS29 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Grik3B1AS29 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Grik3B1AS29 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Grik3B1AS29 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Grik3B1AS29 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Grik3B1AS29 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Grik3B1AS29 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Grik3B1AS29 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Grik3B1AS29 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Grik3B1AS29 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Grik3B1AS29 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Grik3B1AS29 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Grik3B1AS29 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Grik3B1AS29 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Grik3B1AS29 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Grik3B1AS29 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Grik3B1AS29 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Grik3B1AS29 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Grik3B1AS29 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Grik3B1AS29 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Grik3B1AS29 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Grik3B1AS29 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Grik3B1AS29 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Grik3B1AS29 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Grik3B1AS29 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Grik3B1AS29 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Grik3B1AS29 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Grik3B1AS29 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Grik3B1AS29 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Grik3B1AS29 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Grik3B1AS29 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Grik3B1AS29 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Grik3B1AS29 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Grik3B1AS29 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Grik3B1AS29 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Grik3B1AS29 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Grik3B1AS29 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Grik3B1AS29 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Grik3B1AS29 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Grik3B1AS29 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Grik3B1AS29 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Grik3B1AS29 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Grik3B1AS29 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Grik3B1AS29 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Grik3B1AS29 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Grik3B1AS29 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Grik3B1AS29 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Grik3B1AS29 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Grik3B1AS29 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Grik3B1AS29 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Grik3B1AS29 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Grik3B1AS29 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Grik3B1AS29 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Grik3B1AS29 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Grik3B1AS29 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Grik3B1AS29 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Grik3B1AS29 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Grik3B1AS29 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Grik3B1AS29 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Grik3B1AS29 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Grik3B1AS29 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Grik3B1AS29 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Grik3B1AS29 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Grik3B1AS29 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Grik3B1AS29 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Grik3B1AS29 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Grik3B1AS29 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Grik3B1AS29 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Grik3B1AS29 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms