Protein–RNA interactions for Protein: A0A286YDB2

4930469K13Rik, RIKEN cDNA 4930469K13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930469K13RikA0A286YDB2 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
4930469K13RikA0A286YDB2 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
4930469K13RikA0A286YDB2 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
4930469K13RikA0A286YDB2 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
4930469K13RikA0A286YDB2 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
4930469K13RikA0A286YDB2 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
4930469K13RikA0A286YDB2 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
4930469K13RikA0A286YDB2 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
4930469K13RikA0A286YDB2 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
4930469K13RikA0A286YDB2 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
4930469K13RikA0A286YDB2 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
4930469K13RikA0A286YDB2 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
4930469K13RikA0A286YDB2 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
4930469K13RikA0A286YDB2 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
4930469K13RikA0A286YDB2 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
4930469K13RikA0A286YDB2 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
4930469K13RikA0A286YDB2 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
4930469K13RikA0A286YDB2 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
4930469K13RikA0A286YDB2 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
4930469K13RikA0A286YDB2 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
4930469K13RikA0A286YDB2 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
4930469K13RikA0A286YDB2 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
4930469K13RikA0A286YDB2 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
4930469K13RikA0A286YDB2 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
4930469K13RikA0A286YDB2 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
4930469K13RikA0A286YDB2 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
4930469K13RikA0A286YDB2 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
4930469K13RikA0A286YDB2 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
4930469K13RikA0A286YDB2 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
4930469K13RikA0A286YDB2 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
4930469K13RikA0A286YDB2 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
4930469K13RikA0A286YDB2 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
4930469K13RikA0A286YDB2 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
4930469K13RikA0A286YDB2 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
4930469K13RikA0A286YDB2 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
4930469K13RikA0A286YDB2 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
4930469K13RikA0A286YDB2 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
4930469K13RikA0A286YDB2 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
4930469K13RikA0A286YDB2 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
4930469K13RikA0A286YDB2 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
4930469K13RikA0A286YDB2 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
4930469K13RikA0A286YDB2 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
4930469K13RikA0A286YDB2 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
4930469K13RikA0A286YDB2 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
4930469K13RikA0A286YDB2 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
4930469K13RikA0A286YDB2 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
4930469K13RikA0A286YDB2 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
4930469K13RikA0A286YDB2 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
4930469K13RikA0A286YDB2 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
4930469K13RikA0A286YDB2 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
4930469K13RikA0A286YDB2 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
4930469K13RikA0A286YDB2 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
4930469K13RikA0A286YDB2 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
4930469K13RikA0A286YDB2 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
4930469K13RikA0A286YDB2 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
4930469K13RikA0A286YDB2 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
4930469K13RikA0A286YDB2 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
4930469K13RikA0A286YDB2 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
4930469K13RikA0A286YDB2 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
4930469K13RikA0A286YDB2 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
4930469K13RikA0A286YDB2 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
4930469K13RikA0A286YDB2 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
4930469K13RikA0A286YDB2 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
4930469K13RikA0A286YDB2 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
4930469K13RikA0A286YDB2 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
4930469K13RikA0A286YDB2 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
4930469K13RikA0A286YDB2 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
4930469K13RikA0A286YDB2 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
4930469K13RikA0A286YDB2 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
4930469K13RikA0A286YDB2 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
4930469K13RikA0A286YDB2 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
4930469K13RikA0A286YDB2 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
4930469K13RikA0A286YDB2 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
4930469K13RikA0A286YDB2 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
4930469K13RikA0A286YDB2 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
4930469K13RikA0A286YDB2 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
4930469K13RikA0A286YDB2 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
4930469K13RikA0A286YDB2 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
4930469K13RikA0A286YDB2 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
4930469K13RikA0A286YDB2 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
4930469K13RikA0A286YDB2 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
4930469K13RikA0A286YDB2 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
4930469K13RikA0A286YDB2 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
4930469K13RikA0A286YDB2 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
4930469K13RikA0A286YDB2 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms