Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q2

Knop1, Lysine-rich nucleolar protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knop1Q9Z2Q2 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Knop1Q9Z2Q2 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Knop1Q9Z2Q2 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Knop1Q9Z2Q2 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Knop1Q9Z2Q2 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Knop1Q9Z2Q2 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Knop1Q9Z2Q2 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Knop1Q9Z2Q2 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Knop1Q9Z2Q2 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Knop1Q9Z2Q2 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Knop1Q9Z2Q2 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Knop1Q9Z2Q2 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Knop1Q9Z2Q2 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Knop1Q9Z2Q2 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Knop1Q9Z2Q2 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Knop1Q9Z2Q2 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Knop1Q9Z2Q2 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Knop1Q9Z2Q2 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Knop1Q9Z2Q2 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Knop1Q9Z2Q2 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Knop1Q9Z2Q2 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Knop1Q9Z2Q2 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Knop1Q9Z2Q2 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Knop1Q9Z2Q2 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Knop1Q9Z2Q2 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Knop1Q9Z2Q2 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Knop1Q9Z2Q2 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Knop1Q9Z2Q2 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Knop1Q9Z2Q2 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Knop1Q9Z2Q2 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Knop1Q9Z2Q2 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Knop1Q9Z2Q2 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Knop1Q9Z2Q2 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Knop1Q9Z2Q2 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Knop1Q9Z2Q2 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Knop1Q9Z2Q2 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Knop1Q9Z2Q2 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Knop1Q9Z2Q2 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Knop1Q9Z2Q2 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Knop1Q9Z2Q2 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Knop1Q9Z2Q2 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Knop1Q9Z2Q2 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Knop1Q9Z2Q2 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Knop1Q9Z2Q2 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Knop1Q9Z2Q2 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Knop1Q9Z2Q2 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Knop1Q9Z2Q2 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Knop1Q9Z2Q2 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Knop1Q9Z2Q2 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Knop1Q9Z2Q2 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Knop1Q9Z2Q2 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Knop1Q9Z2Q2 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Knop1Q9Z2Q2 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Knop1Q9Z2Q2 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Knop1Q9Z2Q2 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Knop1Q9Z2Q2 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Knop1Q9Z2Q2 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Knop1Q9Z2Q2 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Knop1Q9Z2Q2 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Knop1Q9Z2Q2 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Knop1Q9Z2Q2 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Knop1Q9Z2Q2 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Knop1Q9Z2Q2 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Knop1Q9Z2Q2 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Knop1Q9Z2Q2 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Knop1Q9Z2Q2 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Knop1Q9Z2Q2 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Knop1Q9Z2Q2 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Knop1Q9Z2Q2 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Knop1Q9Z2Q2 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Knop1Q9Z2Q2 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Knop1Q9Z2Q2 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Knop1Q9Z2Q2 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Knop1Q9Z2Q2 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Knop1Q9Z2Q2 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Knop1Q9Z2Q2 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Knop1Q9Z2Q2 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Knop1Q9Z2Q2 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Knop1Q9Z2Q2 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Knop1Q9Z2Q2 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Knop1Q9Z2Q2 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Knop1Q9Z2Q2 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Knop1Q9Z2Q2 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Knop1Q9Z2Q2 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Knop1Q9Z2Q2 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Knop1Q9Z2Q2 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Knop1Q9Z2Q2 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Knop1Q9Z2Q2 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Knop1Q9Z2Q2 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Knop1Q9Z2Q2 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Knop1Q9Z2Q2 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Knop1Q9Z2Q2 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Knop1Q9Z2Q2 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Knop1Q9Z2Q2 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Knop1Q9Z2Q2 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Knop1Q9Z2Q2 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Knop1Q9Z2Q2 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Knop1Q9Z2Q2 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Knop1Q9Z2Q2 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Knop1Q9Z2Q2 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms