Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2P8

Vamp5, Vesicle-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp5Q9Z2P8 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Vamp5Q9Z2P8 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Vamp5Q9Z2P8 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Vamp5Q9Z2P8 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vamp5Q9Z2P8 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms