Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2A0

Pdpk1, 3-phosphoinositide-dependent protein kinase 1, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdpk1Q9Z2A0 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Pdpk1Q9Z2A0 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Pdpk1Q9Z2A0 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdpk1Q9Z2A0 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Pdpk1Q9Z2A0 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdpk1Q9Z2A0 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Pdpk1Q9Z2A0 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Pdpk1Q9Z2A0 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Pdpk1Q9Z2A0 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdpk1Q9Z2A0 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdpk1Q9Z2A0 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdpk1Q9Z2A0 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdpk1Q9Z2A0 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdpk1Q9Z2A0 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdpk1Q9Z2A0 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdpk1Q9Z2A0 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdpk1Q9Z2A0 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdpk1Q9Z2A0 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdpk1Q9Z2A0 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdpk1Q9Z2A0 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Pdpk1Q9Z2A0 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
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