Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Y4

Trip6, Thyroid receptor-interacting protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip6Q9Z1Y4 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trip6Q9Z1Y4 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trip6Q9Z1Y4 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trip6Q9Z1Y4 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trip6Q9Z1Y4 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trip6Q9Z1Y4 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trip6Q9Z1Y4 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trip6Q9Z1Y4 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trip6Q9Z1Y4 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Trip6Q9Z1Y4 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trip6Q9Z1Y4 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Trip6Q9Z1Y4 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Trip6Q9Z1Y4 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trip6Q9Z1Y4 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trip6Q9Z1Y4 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trip6Q9Z1Y4 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trip6Q9Z1Y4 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trip6Q9Z1Y4 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trip6Q9Z1Y4 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trip6Q9Z1Y4 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trip6Q9Z1Y4 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trip6Q9Z1Y4 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trip6Q9Z1Y4 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trip6Q9Z1Y4 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trip6Q9Z1Y4 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trip6Q9Z1Y4 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trip6Q9Z1Y4 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trip6Q9Z1Y4 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trip6Q9Z1Y4 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trip6Q9Z1Y4 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trip6Q9Z1Y4 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trip6Q9Z1Y4 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Trip6Q9Z1Y4 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trip6Q9Z1Y4 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trip6Q9Z1Y4 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Trip6Q9Z1Y4 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trip6Q9Z1Y4 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trip6Q9Z1Y4 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trip6Q9Z1Y4 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trip6Q9Z1Y4 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trip6Q9Z1Y4 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trip6Q9Z1Y4 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trip6Q9Z1Y4 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trip6Q9Z1Y4 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trip6Q9Z1Y4 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trip6Q9Z1Y4 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trip6Q9Z1Y4 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trip6Q9Z1Y4 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trip6Q9Z1Y4 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trip6Q9Z1Y4 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trip6Q9Z1Y4 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trip6Q9Z1Y4 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trip6Q9Z1Y4 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trip6Q9Z1Y4 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trip6Q9Z1Y4 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trip6Q9Z1Y4 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trip6Q9Z1Y4 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trip6Q9Z1Y4 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trip6Q9Z1Y4 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trip6Q9Z1Y4 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trip6Q9Z1Y4 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trip6Q9Z1Y4 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Trip6Q9Z1Y4 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trip6Q9Z1Y4 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trip6Q9Z1Y4 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trip6Q9Z1Y4 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trip6Q9Z1Y4 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Trip6Q9Z1Y4 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trip6Q9Z1Y4 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Trip6Q9Z1Y4 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trip6Q9Z1Y4 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trip6Q9Z1Y4 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trip6Q9Z1Y4 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trip6Q9Z1Y4 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Trip6Q9Z1Y4 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Trip6Q9Z1Y4 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trip6Q9Z1Y4 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trip6Q9Z1Y4 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trip6Q9Z1Y4 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trip6Q9Z1Y4 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trip6Q9Z1Y4 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trip6Q9Z1Y4 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trip6Q9Z1Y4 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trip6Q9Z1Y4 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trip6Q9Z1Y4 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trip6Q9Z1Y4 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trip6Q9Z1Y4 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Trip6Q9Z1Y4 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trip6Q9Z1Y4 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trip6Q9Z1Y4 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trip6Q9Z1Y4 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Trip6Q9Z1Y4 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trip6Q9Z1Y4 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trip6Q9Z1Y4 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trip6Q9Z1Y4 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trip6Q9Z1Y4 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trip6Q9Z1Y4 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trip6Q9Z1Y4 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trip6Q9Z1Y4 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trip6Q9Z1Y4 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms