Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T1

Ap3b1, AP-3 complex subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b1Q9Z1T1 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ap3b1Q9Z1T1 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ap3b1Q9Z1T1 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ap3b1Q9Z1T1 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ap3b1Q9Z1T1 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ap3b1Q9Z1T1 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ap3b1Q9Z1T1 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ap3b1Q9Z1T1 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ap3b1Q9Z1T1 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ap3b1Q9Z1T1 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ap3b1Q9Z1T1 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ap3b1Q9Z1T1 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ap3b1Q9Z1T1 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ap3b1Q9Z1T1 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ap3b1Q9Z1T1 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ap3b1Q9Z1T1 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ap3b1Q9Z1T1 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ap3b1Q9Z1T1 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ap3b1Q9Z1T1 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ap3b1Q9Z1T1 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ap3b1Q9Z1T1 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ap3b1Q9Z1T1 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ap3b1Q9Z1T1 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ap3b1Q9Z1T1 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ap3b1Q9Z1T1 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ap3b1Q9Z1T1 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ap3b1Q9Z1T1 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ap3b1Q9Z1T1 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ap3b1Q9Z1T1 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ap3b1Q9Z1T1 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ap3b1Q9Z1T1 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ap3b1Q9Z1T1 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ap3b1Q9Z1T1 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ap3b1Q9Z1T1 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ap3b1Q9Z1T1 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ap3b1Q9Z1T1 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ap3b1Q9Z1T1 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ap3b1Q9Z1T1 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ap3b1Q9Z1T1 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ap3b1Q9Z1T1 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ap3b1Q9Z1T1 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Ap3b1Q9Z1T1 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ap3b1Q9Z1T1 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ap3b1Q9Z1T1 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ap3b1Q9Z1T1 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ap3b1Q9Z1T1 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ap3b1Q9Z1T1 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ap3b1Q9Z1T1 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ap3b1Q9Z1T1 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ap3b1Q9Z1T1 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ap3b1Q9Z1T1 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ap3b1Q9Z1T1 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ap3b1Q9Z1T1 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ap3b1Q9Z1T1 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ap3b1Q9Z1T1 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ap3b1Q9Z1T1 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Ap3b1Q9Z1T1 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ap3b1Q9Z1T1 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ap3b1Q9Z1T1 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ap3b1Q9Z1T1 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ap3b1Q9Z1T1 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ap3b1Q9Z1T1 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ap3b1Q9Z1T1 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ap3b1Q9Z1T1 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ap3b1Q9Z1T1 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ap3b1Q9Z1T1 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ap3b1Q9Z1T1 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ap3b1Q9Z1T1 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ap3b1Q9Z1T1 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ap3b1Q9Z1T1 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ap3b1Q9Z1T1 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ap3b1Q9Z1T1 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ap3b1Q9Z1T1 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ap3b1Q9Z1T1 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ap3b1Q9Z1T1 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Ap3b1Q9Z1T1 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ap3b1Q9Z1T1 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ap3b1Q9Z1T1 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ap3b1Q9Z1T1 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ap3b1Q9Z1T1 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ap3b1Q9Z1T1 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ap3b1Q9Z1T1 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ap3b1Q9Z1T1 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ap3b1Q9Z1T1 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ap3b1Q9Z1T1 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Ap3b1Q9Z1T1 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ap3b1Q9Z1T1 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ap3b1Q9Z1T1 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ap3b1Q9Z1T1 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ap3b1Q9Z1T1 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ap3b1Q9Z1T1 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ap3b1Q9Z1T1 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ap3b1Q9Z1T1 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ap3b1Q9Z1T1 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ap3b1Q9Z1T1 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ap3b1Q9Z1T1 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms