Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1L5

Cacna2d3, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d3Q9Z1L5 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cacna2d3Q9Z1L5 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cacna2d3Q9Z1L5 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cacna2d3Q9Z1L5 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cacna2d3Q9Z1L5 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cacna2d3Q9Z1L5 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cacna2d3Q9Z1L5 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cacna2d3Q9Z1L5 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cacna2d3Q9Z1L5 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cacna2d3Q9Z1L5 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cacna2d3Q9Z1L5 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cacna2d3Q9Z1L5 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cacna2d3Q9Z1L5 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cacna2d3Q9Z1L5 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cacna2d3Q9Z1L5 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cacna2d3Q9Z1L5 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cacna2d3Q9Z1L5 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cacna2d3Q9Z1L5 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cacna2d3Q9Z1L5 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacna2d3Q9Z1L5 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacna2d3Q9Z1L5 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacna2d3Q9Z1L5 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacna2d3Q9Z1L5 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacna2d3Q9Z1L5 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacna2d3Q9Z1L5 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacna2d3Q9Z1L5 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacna2d3Q9Z1L5 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacna2d3Q9Z1L5 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacna2d3Q9Z1L5 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacna2d3Q9Z1L5 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacna2d3Q9Z1L5 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacna2d3Q9Z1L5 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacna2d3Q9Z1L5 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacna2d3Q9Z1L5 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacna2d3Q9Z1L5 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacna2d3Q9Z1L5 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacna2d3Q9Z1L5 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacna2d3Q9Z1L5 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacna2d3Q9Z1L5 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacna2d3Q9Z1L5 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacna2d3Q9Z1L5 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacna2d3Q9Z1L5 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacna2d3Q9Z1L5 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacna2d3Q9Z1L5 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacna2d3Q9Z1L5 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacna2d3Q9Z1L5 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacna2d3Q9Z1L5 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacna2d3Q9Z1L5 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacna2d3Q9Z1L5 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacna2d3Q9Z1L5 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacna2d3Q9Z1L5 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacna2d3Q9Z1L5 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacna2d3Q9Z1L5 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacna2d3Q9Z1L5 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacna2d3Q9Z1L5 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacna2d3Q9Z1L5 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacna2d3Q9Z1L5 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacna2d3Q9Z1L5 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacna2d3Q9Z1L5 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacna2d3Q9Z1L5 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacna2d3Q9Z1L5 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacna2d3Q9Z1L5 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacna2d3Q9Z1L5 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacna2d3Q9Z1L5 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacna2d3Q9Z1L5 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacna2d3Q9Z1L5 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacna2d3Q9Z1L5 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacna2d3Q9Z1L5 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacna2d3Q9Z1L5 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacna2d3Q9Z1L5 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacna2d3Q9Z1L5 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacna2d3Q9Z1L5 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacna2d3Q9Z1L5 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacna2d3Q9Z1L5 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacna2d3Q9Z1L5 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna2d3Q9Z1L5 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna2d3Q9Z1L5 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms