Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z179

Shcbp1, SHC SH2 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 668 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1Q9Z179 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Shcbp1Q9Z179 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Shcbp1Q9Z179 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Shcbp1Q9Z179 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Shcbp1Q9Z179 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Shcbp1Q9Z179 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Shcbp1Q9Z179 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Shcbp1Q9Z179 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Shcbp1Q9Z179 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Shcbp1Q9Z179 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Shcbp1Q9Z179 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Shcbp1Q9Z179 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Shcbp1Q9Z179 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Shcbp1Q9Z179 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Shcbp1Q9Z179 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Shcbp1Q9Z179 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Shcbp1Q9Z179 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Shcbp1Q9Z179 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Shcbp1Q9Z179 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Shcbp1Q9Z179 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Shcbp1Q9Z179 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Shcbp1Q9Z179 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Shcbp1Q9Z179 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Shcbp1Q9Z179 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Shcbp1Q9Z179 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Shcbp1Q9Z179 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Shcbp1Q9Z179 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Shcbp1Q9Z179 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Shcbp1Q9Z179 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Shcbp1Q9Z179 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Shcbp1Q9Z179 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Shcbp1Q9Z179 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Shcbp1Q9Z179 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Shcbp1Q9Z179 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Shcbp1Q9Z179 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Shcbp1Q9Z179 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Shcbp1Q9Z179 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Shcbp1Q9Z179 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Shcbp1Q9Z179 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Shcbp1Q9Z179 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Shcbp1Q9Z179 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Shcbp1Q9Z179 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Shcbp1Q9Z179 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Shcbp1Q9Z179 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Shcbp1Q9Z179 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Shcbp1Q9Z179 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Shcbp1Q9Z179 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Shcbp1Q9Z179 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Shcbp1Q9Z179 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Shcbp1Q9Z179 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Shcbp1Q9Z179 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Shcbp1Q9Z179 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Shcbp1Q9Z179 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Shcbp1Q9Z179 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Shcbp1Q9Z179 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Shcbp1Q9Z179 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Shcbp1Q9Z179 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Shcbp1Q9Z179 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Shcbp1Q9Z179 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Shcbp1Q9Z179 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Shcbp1Q9Z179 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Shcbp1Q9Z179 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Shcbp1Q9Z179 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Shcbp1Q9Z179 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Shcbp1Q9Z179 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Shcbp1Q9Z179 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Shcbp1Q9Z179 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shcbp1Q9Z179 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shcbp1Q9Z179 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shcbp1Q9Z179 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shcbp1Q9Z179 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Shcbp1Q9Z179 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shcbp1Q9Z179 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shcbp1Q9Z179 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shcbp1Q9Z179 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shcbp1Q9Z179 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shcbp1Q9Z179 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shcbp1Q9Z179 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shcbp1Q9Z179 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shcbp1Q9Z179 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shcbp1Q9Z179 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shcbp1Q9Z179 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shcbp1Q9Z179 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shcbp1Q9Z179 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shcbp1Q9Z179 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shcbp1Q9Z179 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Shcbp1Q9Z179 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shcbp1Q9Z179 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Shcbp1Q9Z179 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shcbp1Q9Z179 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shcbp1Q9Z179 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shcbp1Q9Z179 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shcbp1Q9Z179 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shcbp1Q9Z179 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shcbp1Q9Z179 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shcbp1Q9Z179 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shcbp1Q9Z179 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Shcbp1Q9Z179 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Shcbp1Q9Z179 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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