Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0W1

Ngfr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NgfrQ9Z0W1 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
NgfrQ9Z0W1 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms