Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0G9

Cldn3, Claudin-3, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn3Q9Z0G9 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn3Q9Z0G9 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn3Q9Z0G9 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn3Q9Z0G9 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn3Q9Z0G9 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn3Q9Z0G9 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn3Q9Z0G9 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn3Q9Z0G9 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn3Q9Z0G9 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn3Q9Z0G9 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn3Q9Z0G9 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn3Q9Z0G9 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn3Q9Z0G9 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn3Q9Z0G9 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn3Q9Z0G9 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn3Q9Z0G9 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn3Q9Z0G9 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn3Q9Z0G9 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn3Q9Z0G9 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn3Q9Z0G9 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn3Q9Z0G9 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cldn3Q9Z0G9 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn3Q9Z0G9 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn3Q9Z0G9 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn3Q9Z0G9 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn3Q9Z0G9 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn3Q9Z0G9 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn3Q9Z0G9 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn3Q9Z0G9 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn3Q9Z0G9 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn3Q9Z0G9 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn3Q9Z0G9 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn3Q9Z0G9 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn3Q9Z0G9 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn3Q9Z0G9 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn3Q9Z0G9 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn3Q9Z0G9 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn3Q9Z0G9 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn3Q9Z0G9 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn3Q9Z0G9 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn3Q9Z0G9 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn3Q9Z0G9 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn3Q9Z0G9 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn3Q9Z0G9 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn3Q9Z0G9 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn3Q9Z0G9 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn3Q9Z0G9 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn3Q9Z0G9 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn3Q9Z0G9 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn3Q9Z0G9 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn3Q9Z0G9 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn3Q9Z0G9 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn3Q9Z0G9 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn3Q9Z0G9 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn3Q9Z0G9 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn3Q9Z0G9 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn3Q9Z0G9 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn3Q9Z0G9 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cldn3Q9Z0G9 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cldn3Q9Z0G9 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cldn3Q9Z0G9 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cldn3Q9Z0G9 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cldn3Q9Z0G9 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cldn3Q9Z0G9 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn3Q9Z0G9 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn3Q9Z0G9 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn3Q9Z0G9 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn3Q9Z0G9 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cldn3Q9Z0G9 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn3Q9Z0G9 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn3Q9Z0G9 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cldn3Q9Z0G9 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cldn3Q9Z0G9 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn3Q9Z0G9 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn3Q9Z0G9 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn3Q9Z0G9 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn3Q9Z0G9 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cldn3Q9Z0G9 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn3Q9Z0G9 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn3Q9Z0G9 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn3Q9Z0G9 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cldn3Q9Z0G9 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn3Q9Z0G9 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cldn3Q9Z0G9 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn3Q9Z0G9 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn3Q9Z0G9 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn3Q9Z0G9 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn3Q9Z0G9 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn3Q9Z0G9 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn3Q9Z0G9 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn3Q9Z0G9 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn3Q9Z0G9 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn3Q9Z0G9 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn3Q9Z0G9 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn3Q9Z0G9 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn3Q9Z0G9 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn3Q9Z0G9 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn3Q9Z0G9 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn3Q9Z0G9 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn3Q9Z0G9 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms