Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUH5

Trim10, Tripartite motif-containing protein 10, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim10Q9WUH5 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim10Q9WUH5 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim10Q9WUH5 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim10Q9WUH5 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim10Q9WUH5 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim10Q9WUH5 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim10Q9WUH5 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim10Q9WUH5 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim10Q9WUH5 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim10Q9WUH5 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim10Q9WUH5 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim10Q9WUH5 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim10Q9WUH5 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim10Q9WUH5 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim10Q9WUH5 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim10Q9WUH5 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim10Q9WUH5 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim10Q9WUH5 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim10Q9WUH5 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim10Q9WUH5 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim10Q9WUH5 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim10Q9WUH5 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim10Q9WUH5 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim10Q9WUH5 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim10Q9WUH5 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim10Q9WUH5 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim10Q9WUH5 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim10Q9WUH5 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim10Q9WUH5 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim10Q9WUH5 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim10Q9WUH5 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim10Q9WUH5 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim10Q9WUH5 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim10Q9WUH5 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim10Q9WUH5 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim10Q9WUH5 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim10Q9WUH5 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim10Q9WUH5 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim10Q9WUH5 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim10Q9WUH5 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim10Q9WUH5 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim10Q9WUH5 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim10Q9WUH5 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim10Q9WUH5 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim10Q9WUH5 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim10Q9WUH5 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim10Q9WUH5 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim10Q9WUH5 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim10Q9WUH5 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim10Q9WUH5 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim10Q9WUH5 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim10Q9WUH5 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim10Q9WUH5 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim10Q9WUH5 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim10Q9WUH5 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim10Q9WUH5 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim10Q9WUH5 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim10Q9WUH5 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim10Q9WUH5 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim10Q9WUH5 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim10Q9WUH5 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim10Q9WUH5 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim10Q9WUH5 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim10Q9WUH5 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim10Q9WUH5 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim10Q9WUH5 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim10Q9WUH5 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim10Q9WUH5 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim10Q9WUH5 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim10Q9WUH5 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim10Q9WUH5 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim10Q9WUH5 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim10Q9WUH5 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim10Q9WUH5 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim10Q9WUH5 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim10Q9WUH5 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim10Q9WUH5 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim10Q9WUH5 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim10Q9WUH5 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim10Q9WUH5 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim10Q9WUH5 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim10Q9WUH5 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim10Q9WUH5 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim10Q9WUH5 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim10Q9WUH5 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim10Q9WUH5 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim10Q9WUH5 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim10Q9WUH5 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim10Q9WUH5 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim10Q9WUH5 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim10Q9WUH5 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim10Q9WUH5 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim10Q9WUH5 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim10Q9WUH5 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim10Q9WUH5 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim10Q9WUH5 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim10Q9WUH5 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim10Q9WUH5 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim10Q9WUH5 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim10Q9WUH5 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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