Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTV6

Usp18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp18Q9WTV6 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp18Q9WTV6 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp18Q9WTV6 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp18Q9WTV6 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp18Q9WTV6 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp18Q9WTV6 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp18Q9WTV6 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp18Q9WTV6 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp18Q9WTV6 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp18Q9WTV6 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp18Q9WTV6 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp18Q9WTV6 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp18Q9WTV6 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp18Q9WTV6 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp18Q9WTV6 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp18Q9WTV6 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp18Q9WTV6 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp18Q9WTV6 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp18Q9WTV6 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp18Q9WTV6 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp18Q9WTV6 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp18Q9WTV6 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp18Q9WTV6 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp18Q9WTV6 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp18Q9WTV6 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp18Q9WTV6 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp18Q9WTV6 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp18Q9WTV6 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp18Q9WTV6 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp18Q9WTV6 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp18Q9WTV6 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp18Q9WTV6 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp18Q9WTV6 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp18Q9WTV6 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp18Q9WTV6 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp18Q9WTV6 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp18Q9WTV6 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp18Q9WTV6 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp18Q9WTV6 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp18Q9WTV6 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp18Q9WTV6 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp18Q9WTV6 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp18Q9WTV6 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp18Q9WTV6 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp18Q9WTV6 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp18Q9WTV6 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp18Q9WTV6 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp18Q9WTV6 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp18Q9WTV6 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp18Q9WTV6 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp18Q9WTV6 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp18Q9WTV6 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp18Q9WTV6 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp18Q9WTV6 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp18Q9WTV6 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp18Q9WTV6 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp18Q9WTV6 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp18Q9WTV6 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp18Q9WTV6 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp18Q9WTV6 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp18Q9WTV6 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp18Q9WTV6 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp18Q9WTV6 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp18Q9WTV6 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp18Q9WTV6 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp18Q9WTV6 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp18Q9WTV6 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp18Q9WTV6 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp18Q9WTV6 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp18Q9WTV6 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp18Q9WTV6 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp18Q9WTV6 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp18Q9WTV6 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp18Q9WTV6 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp18Q9WTV6 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp18Q9WTV6 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp18Q9WTV6 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp18Q9WTV6 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp18Q9WTV6 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp18Q9WTV6 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp18Q9WTV6 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp18Q9WTV6 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp18Q9WTV6 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp18Q9WTV6 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp18Q9WTV6 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp18Q9WTV6 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp18Q9WTV6 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp18Q9WTV6 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp18Q9WTV6 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp18Q9WTV6 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp18Q9WTV6 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp18Q9WTV6 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp18Q9WTV6 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp18Q9WTV6 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp18Q9WTV6 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp18Q9WTV6 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp18Q9WTV6 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp18Q9WTV6 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp18Q9WTV6 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp18Q9WTV6 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms