Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1K7

Tubd1, Tubulin delta chain, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubd1Q9R1K7 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubd1Q9R1K7 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubd1Q9R1K7 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubd1Q9R1K7 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubd1Q9R1K7 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubd1Q9R1K7 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubd1Q9R1K7 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubd1Q9R1K7 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubd1Q9R1K7 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubd1Q9R1K7 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubd1Q9R1K7 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubd1Q9R1K7 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubd1Q9R1K7 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubd1Q9R1K7 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubd1Q9R1K7 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubd1Q9R1K7 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubd1Q9R1K7 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubd1Q9R1K7 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubd1Q9R1K7 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubd1Q9R1K7 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubd1Q9R1K7 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubd1Q9R1K7 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubd1Q9R1K7 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubd1Q9R1K7 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tubd1Q9R1K7 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubd1Q9R1K7 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubd1Q9R1K7 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubd1Q9R1K7 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubd1Q9R1K7 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubd1Q9R1K7 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubd1Q9R1K7 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubd1Q9R1K7 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubd1Q9R1K7 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubd1Q9R1K7 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubd1Q9R1K7 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubd1Q9R1K7 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubd1Q9R1K7 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubd1Q9R1K7 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubd1Q9R1K7 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubd1Q9R1K7 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubd1Q9R1K7 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubd1Q9R1K7 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubd1Q9R1K7 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubd1Q9R1K7 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubd1Q9R1K7 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubd1Q9R1K7 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubd1Q9R1K7 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubd1Q9R1K7 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubd1Q9R1K7 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubd1Q9R1K7 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubd1Q9R1K7 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubd1Q9R1K7 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubd1Q9R1K7 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubd1Q9R1K7 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubd1Q9R1K7 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubd1Q9R1K7 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubd1Q9R1K7 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubd1Q9R1K7 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubd1Q9R1K7 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubd1Q9R1K7 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubd1Q9R1K7 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tubd1Q9R1K7 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tubd1Q9R1K7 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tubd1Q9R1K7 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tubd1Q9R1K7 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tubd1Q9R1K7 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tubd1Q9R1K7 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tubd1Q9R1K7 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tubd1Q9R1K7 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tubd1Q9R1K7 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tubd1Q9R1K7 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tubd1Q9R1K7 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tubd1Q9R1K7 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Tubd1Q9R1K7 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tubd1Q9R1K7 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Tubd1Q9R1K7 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tubd1Q9R1K7 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tubd1Q9R1K7 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tubd1Q9R1K7 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tubd1Q9R1K7 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tubd1Q9R1K7 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Tubd1Q9R1K7 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tubd1Q9R1K7 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Tubd1Q9R1K7 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tubd1Q9R1K7 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tubd1Q9R1K7 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tubd1Q9R1K7 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tubd1Q9R1K7 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tubd1Q9R1K7 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tubd1Q9R1K7 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tubd1Q9R1K7 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tubd1Q9R1K7 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tubd1Q9R1K7 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tubd1Q9R1K7 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tubd1Q9R1K7 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tubd1Q9R1K7 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tubd1Q9R1K7 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tubd1Q9R1K7 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tubd1Q9R1K7 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tubd1Q9R1K7 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms