Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E1

Plod3, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 3, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod3Q9R0E1 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Plod3Q9R0E1 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Plod3Q9R0E1 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Plod3Q9R0E1 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Plod3Q9R0E1 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Plod3Q9R0E1 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Plod3Q9R0E1 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Plod3Q9R0E1 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Plod3Q9R0E1 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Plod3Q9R0E1 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Plod3Q9R0E1 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Plod3Q9R0E1 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Plod3Q9R0E1 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Plod3Q9R0E1 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Plod3Q9R0E1 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Plod3Q9R0E1 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Plod3Q9R0E1 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Plod3Q9R0E1 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Plod3Q9R0E1 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Plod3Q9R0E1 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Plod3Q9R0E1 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Plod3Q9R0E1 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Plod3Q9R0E1 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Plod3Q9R0E1 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Plod3Q9R0E1 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Plod3Q9R0E1 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Plod3Q9R0E1 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Plod3Q9R0E1 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Plod3Q9R0E1 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Plod3Q9R0E1 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Plod3Q9R0E1 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Plod3Q9R0E1 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Plod3Q9R0E1 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Plod3Q9R0E1 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Plod3Q9R0E1 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Plod3Q9R0E1 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Plod3Q9R0E1 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Plod3Q9R0E1 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Plod3Q9R0E1 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Plod3Q9R0E1 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Plod3Q9R0E1 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Plod3Q9R0E1 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Plod3Q9R0E1 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Plod3Q9R0E1 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Plod3Q9R0E1 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Plod3Q9R0E1 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Plod3Q9R0E1 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Plod3Q9R0E1 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Plod3Q9R0E1 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Plod3Q9R0E1 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Plod3Q9R0E1 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Plod3Q9R0E1 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Plod3Q9R0E1 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Plod3Q9R0E1 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Plod3Q9R0E1 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Plod3Q9R0E1 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Plod3Q9R0E1 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Plod3Q9R0E1 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Plod3Q9R0E1 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Plod3Q9R0E1 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Plod3Q9R0E1 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Plod3Q9R0E1 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Plod3Q9R0E1 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Plod3Q9R0E1 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Plod3Q9R0E1 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Plod3Q9R0E1 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Plod3Q9R0E1 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Plod3Q9R0E1 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Plod3Q9R0E1 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Plod3Q9R0E1 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Plod3Q9R0E1 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Plod3Q9R0E1 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Plod3Q9R0E1 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Plod3Q9R0E1 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Plod3Q9R0E1 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Plod3Q9R0E1 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Plod3Q9R0E1 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Plod3Q9R0E1 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Plod3Q9R0E1 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Plod3Q9R0E1 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Plod3Q9R0E1 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Plod3Q9R0E1 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Plod3Q9R0E1 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Plod3Q9R0E1 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Plod3Q9R0E1 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Plod3Q9R0E1 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Plod3Q9R0E1 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Plod3Q9R0E1 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Plod3Q9R0E1 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Plod3Q9R0E1 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Plod3Q9R0E1 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Plod3Q9R0E1 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Plod3Q9R0E1 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Plod3Q9R0E1 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Plod3Q9R0E1 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Plod3Q9R0E1 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Plod3Q9R0E1 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Plod3Q9R0E1 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Plod3Q9R0E1 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Plod3Q9R0E1 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms