Protein–RNA interactions for Protein: Q9R049

Amfr, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmfrQ9R049 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AmfrQ9R049 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
AmfrQ9R049 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AmfrQ9R049 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
AmfrQ9R049 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
AmfrQ9R049 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
AmfrQ9R049 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AmfrQ9R049 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AmfrQ9R049 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
AmfrQ9R049 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AmfrQ9R049 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
AmfrQ9R049 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AmfrQ9R049 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
AmfrQ9R049 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AmfrQ9R049 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
AmfrQ9R049 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
AmfrQ9R049 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
AmfrQ9R049 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AmfrQ9R049 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
AmfrQ9R049 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AmfrQ9R049 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
AmfrQ9R049 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AmfrQ9R049 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AmfrQ9R049 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AmfrQ9R049 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AmfrQ9R049 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AmfrQ9R049 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
AmfrQ9R049 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AmfrQ9R049 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
AmfrQ9R049 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AmfrQ9R049 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AmfrQ9R049 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AmfrQ9R049 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AmfrQ9R049 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AmfrQ9R049 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AmfrQ9R049 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
AmfrQ9R049 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
AmfrQ9R049 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
AmfrQ9R049 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AmfrQ9R049 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AmfrQ9R049 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AmfrQ9R049 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
AmfrQ9R049 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AmfrQ9R049 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
AmfrQ9R049 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
AmfrQ9R049 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
AmfrQ9R049 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
AmfrQ9R049 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
AmfrQ9R049 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
AmfrQ9R049 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
AmfrQ9R049 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AmfrQ9R049 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
AmfrQ9R049 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
AmfrQ9R049 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AmfrQ9R049 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AmfrQ9R049 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AmfrQ9R049 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
AmfrQ9R049 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AmfrQ9R049 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AmfrQ9R049 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
AmfrQ9R049 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AmfrQ9R049 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AmfrQ9R049 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
AmfrQ9R049 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
AmfrQ9R049 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
AmfrQ9R049 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
AmfrQ9R049 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
AmfrQ9R049 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
AmfrQ9R049 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
AmfrQ9R049 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
AmfrQ9R049 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
AmfrQ9R049 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
AmfrQ9R049 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
AmfrQ9R049 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
AmfrQ9R049 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
AmfrQ9R049 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
AmfrQ9R049 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
AmfrQ9R049 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
AmfrQ9R049 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
AmfrQ9R049 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
AmfrQ9R049 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
AmfrQ9R049 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
AmfrQ9R049 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
AmfrQ9R049 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
AmfrQ9R049 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
AmfrQ9R049 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
AmfrQ9R049 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
AmfrQ9R049 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
AmfrQ9R049 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
AmfrQ9R049 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
AmfrQ9R049 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
AmfrQ9R049 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
AmfrQ9R049 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
AmfrQ9R049 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
AmfrQ9R049 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
AmfrQ9R049 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
AmfrQ9R049 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
AmfrQ9R049 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
AmfrQ9R049 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
AmfrQ9R049 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8 ms