Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZC1

Trpc3, Short transient receptor potential channel 3, mousemouse

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Length 836 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc3Q9QZC1 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Trpc3Q9QZC1 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trpc3Q9QZC1 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Trpc3Q9QZC1 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Trpc3Q9QZC1 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trpc3Q9QZC1 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Trpc3Q9QZC1 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Trpc3Q9QZC1 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
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Trpc3Q9QZC1 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trpc3Q9QZC1 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trpc3Q9QZC1 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trpc3Q9QZC1 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trpc3Q9QZC1 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trpc3Q9QZC1 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trpc3Q9QZC1 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trpc3Q9QZC1 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trpc3Q9QZC1 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trpc3Q9QZC1 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trpc3Q9QZC1 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trpc3Q9QZC1 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trpc3Q9QZC1 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trpc3Q9QZC1 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trpc3Q9QZC1 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trpc3Q9QZC1 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trpc3Q9QZC1 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trpc3Q9QZC1 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trpc3Q9QZC1 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trpc3Q9QZC1 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trpc3Q9QZC1 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trpc3Q9QZC1 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trpc3Q9QZC1 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trpc3Q9QZC1 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trpc3Q9QZC1 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trpc3Q9QZC1 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trpc3Q9QZC1 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trpc3Q9QZC1 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trpc3Q9QZC1 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Trpc3Q9QZC1 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Trpc3Q9QZC1 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Trpc3Q9QZC1 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Trpc3Q9QZC1 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trpc3Q9QZC1 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trpc3Q9QZC1 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trpc3Q9QZC1 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trpc3Q9QZC1 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trpc3Q9QZC1 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Trpc3Q9QZC1 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Trpc3Q9QZC1 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trpc3Q9QZC1 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trpc3Q9QZC1 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Trpc3Q9QZC1 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Trpc3Q9QZC1 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trpc3Q9QZC1 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Trpc3Q9QZC1 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trpc3Q9QZC1 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trpc3Q9QZC1 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trpc3Q9QZC1 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trpc3Q9QZC1 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trpc3Q9QZC1 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trpc3Q9QZC1 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trpc3Q9QZC1 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trpc3Q9QZC1 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trpc3Q9QZC1 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trpc3Q9QZC1 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trpc3Q9QZC1 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trpc3Q9QZC1 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trpc3Q9QZC1 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trpc3Q9QZC1 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trpc3Q9QZC1 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trpc3Q9QZC1 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trpc3Q9QZC1 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.9 ms