Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY31

Snai3, Zinc finger protein SNAI3, mousemouse

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Length 287 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snai3Q9QY31 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Snai3Q9QY31 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Snai3Q9QY31 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Snai3Q9QY31 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Snai3Q9QY31 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Snai3Q9QY31 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Snai3Q9QY31 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Snai3Q9QY31 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Snai3Q9QY31 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Snai3Q9QY31 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Snai3Q9QY31 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Snai3Q9QY31 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Snai3Q9QY31 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Snai3Q9QY31 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Snai3Q9QY31 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Snai3Q9QY31 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Snai3Q9QY31 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Snai3Q9QY31 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Snai3Q9QY31 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Snai3Q9QY31 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Snai3Q9QY31 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Snai3Q9QY31 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Snai3Q9QY31 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Snai3Q9QY31 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Snai3Q9QY31 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Snai3Q9QY31 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Snai3Q9QY31 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Snai3Q9QY31 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Snai3Q9QY31 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Snai3Q9QY31 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Snai3Q9QY31 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Snai3Q9QY31 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Snai3Q9QY31 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Snai3Q9QY31 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Snai3Q9QY31 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Snai3Q9QY31 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Snai3Q9QY31 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Snai3Q9QY31 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Snai3Q9QY31 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Snai3Q9QY31 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Snai3Q9QY31 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Snai3Q9QY31 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Snai3Q9QY31 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Snai3Q9QY31 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Snai3Q9QY31 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Snai3Q9QY31 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Snai3Q9QY31 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Snai3Q9QY31 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Snai3Q9QY31 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Snai3Q9QY31 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Snai3Q9QY31 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Snai3Q9QY31 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Snai3Q9QY31 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Snai3Q9QY31 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Snai3Q9QY31 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Snai3Q9QY31 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Snai3Q9QY31 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Snai3Q9QY31 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Snai3Q9QY31 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Snai3Q9QY31 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Snai3Q9QY31 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Snai3Q9QY31 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Snai3Q9QY31 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Snai3Q9QY31 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Snai3Q9QY31 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Snai3Q9QY31 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Snai3Q9QY31 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Snai3Q9QY31 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Snai3Q9QY31 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Snai3Q9QY31 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Snai3Q9QY31 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Snai3Q9QY31 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Snai3Q9QY31 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Snai3Q9QY31 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Snai3Q9QY31 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Snai3Q9QY31 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Snai3Q9QY31 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Snai3Q9QY31 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Snai3Q9QY31 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms