Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ7

Nr2e3, Photoreceptor-specific nuclear receptor, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2e3Q9QXZ7 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nr2e3Q9QXZ7 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nr2e3Q9QXZ7 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nr2e3Q9QXZ7 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nr2e3Q9QXZ7 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nr2e3Q9QXZ7 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nr2e3Q9QXZ7 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nr2e3Q9QXZ7 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Nr2e3Q9QXZ7 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nr2e3Q9QXZ7 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nr2e3Q9QXZ7 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nr2e3Q9QXZ7 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nr2e3Q9QXZ7 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nr2e3Q9QXZ7 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Nr2e3Q9QXZ7 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nr2e3Q9QXZ7 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nr2e3Q9QXZ7 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Nr2e3Q9QXZ7 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nr2e3Q9QXZ7 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nr2e3Q9QXZ7 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nr2e3Q9QXZ7 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nr2e3Q9QXZ7 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nr2e3Q9QXZ7 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nr2e3Q9QXZ7 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nr2e3Q9QXZ7 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nr2e3Q9QXZ7 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nr2e3Q9QXZ7 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nr2e3Q9QXZ7 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nr2e3Q9QXZ7 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nr2e3Q9QXZ7 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nr2e3Q9QXZ7 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nr2e3Q9QXZ7 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nr2e3Q9QXZ7 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nr2e3Q9QXZ7 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nr2e3Q9QXZ7 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Nr2e3Q9QXZ7 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nr2e3Q9QXZ7 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nr2e3Q9QXZ7 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nr2e3Q9QXZ7 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nr2e3Q9QXZ7 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Nr2e3Q9QXZ7 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Nr2e3Q9QXZ7 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Nr2e3Q9QXZ7 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Nr2e3Q9QXZ7 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nr2e3Q9QXZ7 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nr2e3Q9QXZ7 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nr2e3Q9QXZ7 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nr2e3Q9QXZ7 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nr2e3Q9QXZ7 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nr2e3Q9QXZ7 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nr2e3Q9QXZ7 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nr2e3Q9QXZ7 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nr2e3Q9QXZ7 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nr2e3Q9QXZ7 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nr2e3Q9QXZ7 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nr2e3Q9QXZ7 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Nr2e3Q9QXZ7 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nr2e3Q9QXZ7 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nr2e3Q9QXZ7 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nr2e3Q9QXZ7 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nr2e3Q9QXZ7 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nr2e3Q9QXZ7 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nr2e3Q9QXZ7 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nr2e3Q9QXZ7 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nr2e3Q9QXZ7 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nr2e3Q9QXZ7 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nr2e3Q9QXZ7 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nr2e3Q9QXZ7 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nr2e3Q9QXZ7 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nr2e3Q9QXZ7 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nr2e3Q9QXZ7 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nr2e3Q9QXZ7 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nr2e3Q9QXZ7 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nr2e3Q9QXZ7 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nr2e3Q9QXZ7 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nr2e3Q9QXZ7 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nr2e3Q9QXZ7 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nr2e3Q9QXZ7 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nr2e3Q9QXZ7 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nr2e3Q9QXZ7 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nr2e3Q9QXZ7 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nr2e3Q9QXZ7 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nr2e3Q9QXZ7 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nr2e3Q9QXZ7 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nr2e3Q9QXZ7 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nr2e3Q9QXZ7 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nr2e3Q9QXZ7 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nr2e3Q9QXZ7 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nr2e3Q9QXZ7 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nr2e3Q9QXZ7 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nr2e3Q9QXZ7 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nr2e3Q9QXZ7 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nr2e3Q9QXZ7 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nr2e3Q9QXZ7 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nr2e3Q9QXZ7 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nr2e3Q9QXZ7 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nr2e3Q9QXZ7 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nr2e3Q9QXZ7 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nr2e3Q9QXZ7 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Nr2e3Q9QXZ7 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms