Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV0

Pcsk1n, ProSAAS, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk1nQ9QXV0 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcsk1nQ9QXV0 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcsk1nQ9QXV0 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcsk1nQ9QXV0 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcsk1nQ9QXV0 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pcsk1nQ9QXV0 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcsk1nQ9QXV0 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcsk1nQ9QXV0 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcsk1nQ9QXV0 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcsk1nQ9QXV0 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcsk1nQ9QXV0 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcsk1nQ9QXV0 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcsk1nQ9QXV0 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcsk1nQ9QXV0 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcsk1nQ9QXV0 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcsk1nQ9QXV0 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcsk1nQ9QXV0 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcsk1nQ9QXV0 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcsk1nQ9QXV0 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcsk1nQ9QXV0 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcsk1nQ9QXV0 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcsk1nQ9QXV0 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcsk1nQ9QXV0 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcsk1nQ9QXV0 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcsk1nQ9QXV0 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcsk1nQ9QXV0 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcsk1nQ9QXV0 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcsk1nQ9QXV0 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcsk1nQ9QXV0 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcsk1nQ9QXV0 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcsk1nQ9QXV0 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcsk1nQ9QXV0 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcsk1nQ9QXV0 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcsk1nQ9QXV0 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcsk1nQ9QXV0 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcsk1nQ9QXV0 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcsk1nQ9QXV0 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcsk1nQ9QXV0 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcsk1nQ9QXV0 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcsk1nQ9QXV0 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcsk1nQ9QXV0 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcsk1nQ9QXV0 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcsk1nQ9QXV0 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcsk1nQ9QXV0 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pcsk1nQ9QXV0 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pcsk1nQ9QXV0 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pcsk1nQ9QXV0 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pcsk1nQ9QXV0 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pcsk1nQ9QXV0 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pcsk1nQ9QXV0 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pcsk1nQ9QXV0 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pcsk1nQ9QXV0 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pcsk1nQ9QXV0 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pcsk1nQ9QXV0 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pcsk1nQ9QXV0 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pcsk1nQ9QXV0 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pcsk1nQ9QXV0 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pcsk1nQ9QXV0 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pcsk1nQ9QXV0 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pcsk1nQ9QXV0 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pcsk1nQ9QXV0 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pcsk1nQ9QXV0 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pcsk1nQ9QXV0 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pcsk1nQ9QXV0 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pcsk1nQ9QXV0 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pcsk1nQ9QXV0 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pcsk1nQ9QXV0 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pcsk1nQ9QXV0 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pcsk1nQ9QXV0 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pcsk1nQ9QXV0 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pcsk1nQ9QXV0 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcsk1nQ9QXV0 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcsk1nQ9QXV0 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcsk1nQ9QXV0 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcsk1nQ9QXV0 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcsk1nQ9QXV0 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcsk1nQ9QXV0 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcsk1nQ9QXV0 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcsk1nQ9QXV0 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcsk1nQ9QXV0 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcsk1nQ9QXV0 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcsk1nQ9QXV0 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcsk1nQ9QXV0 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcsk1nQ9QXV0 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcsk1nQ9QXV0 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcsk1nQ9QXV0 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcsk1nQ9QXV0 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcsk1nQ9QXV0 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcsk1nQ9QXV0 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcsk1nQ9QXV0 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcsk1nQ9QXV0 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcsk1nQ9QXV0 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcsk1nQ9QXV0 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcsk1nQ9QXV0 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcsk1nQ9QXV0 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcsk1nQ9QXV0 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcsk1nQ9QXV0 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcsk1nQ9QXV0 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pcsk1nQ9QXV0 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pcsk1nQ9QXV0 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.3 ms