Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT8

Kcnip3, Calsenilin, mousemouse

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Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip3Q9QXT8 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Kcnip3Q9QXT8 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Kcnip3Q9QXT8 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Kcnip3Q9QXT8 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Kcnip3Q9QXT8 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Kcnip3Q9QXT8 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Kcnip3Q9QXT8 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Kcnip3Q9QXT8 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Kcnip3Q9QXT8 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Kcnip3Q9QXT8 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Kcnip3Q9QXT8 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Kcnip3Q9QXT8 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Kcnip3Q9QXT8 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Kcnip3Q9QXT8 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Kcnip3Q9QXT8 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Kcnip3Q9QXT8 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Kcnip3Q9QXT8 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Kcnip3Q9QXT8 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Kcnip3Q9QXT8 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Kcnip3Q9QXT8 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Kcnip3Q9QXT8 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Kcnip3Q9QXT8 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Kcnip3Q9QXT8 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Kcnip3Q9QXT8 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Kcnip3Q9QXT8 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Kcnip3Q9QXT8 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Kcnip3Q9QXT8 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Kcnip3Q9QXT8 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Kcnip3Q9QXT8 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Kcnip3Q9QXT8 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Kcnip3Q9QXT8 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Kcnip3Q9QXT8 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Kcnip3Q9QXT8 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Kcnip3Q9QXT8 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Kcnip3Q9QXT8 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Kcnip3Q9QXT8 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Kcnip3Q9QXT8 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Kcnip3Q9QXT8 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Kcnip3Q9QXT8 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Kcnip3Q9QXT8 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Kcnip3Q9QXT8 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Kcnip3Q9QXT8 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Kcnip3Q9QXT8 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Kcnip3Q9QXT8 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Kcnip3Q9QXT8 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Kcnip3Q9QXT8 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Kcnip3Q9QXT8 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Kcnip3Q9QXT8 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Kcnip3Q9QXT8 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Kcnip3Q9QXT8 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Kcnip3Q9QXT8 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Kcnip3Q9QXT8 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Kcnip3Q9QXT8 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Kcnip3Q9QXT8 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Kcnip3Q9QXT8 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Kcnip3Q9QXT8 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Kcnip3Q9QXT8 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Kcnip3Q9QXT8 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Kcnip3Q9QXT8 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Kcnip3Q9QXT8 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Kcnip3Q9QXT8 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Kcnip3Q9QXT8 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Kcnip3Q9QXT8 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Kcnip3Q9QXT8 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Kcnip3Q9QXT8 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Kcnip3Q9QXT8 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Kcnip3Q9QXT8 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Kcnip3Q9QXT8 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Kcnip3Q9QXT8 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Kcnip3Q9QXT8 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Kcnip3Q9QXT8 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Kcnip3Q9QXT8 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Kcnip3Q9QXT8 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Kcnip3Q9QXT8 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Kcnip3Q9QXT8 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Kcnip3Q9QXT8 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Kcnip3Q9QXT8 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Kcnip3Q9QXT8 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Kcnip3Q9QXT8 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Kcnip3Q9QXT8 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Kcnip3Q9QXT8 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Kcnip3Q9QXT8 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Kcnip3Q9QXT8 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Kcnip3Q9QXT8 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Kcnip3Q9QXT8 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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