Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWV1

H2-Oa, H2-O alpha, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-OaQ9QWV1 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-OaQ9QWV1 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-OaQ9QWV1 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-OaQ9QWV1 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-OaQ9QWV1 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-OaQ9QWV1 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-OaQ9QWV1 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-OaQ9QWV1 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-OaQ9QWV1 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-OaQ9QWV1 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-OaQ9QWV1 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-OaQ9QWV1 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-OaQ9QWV1 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-OaQ9QWV1 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-OaQ9QWV1 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-OaQ9QWV1 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-OaQ9QWV1 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-OaQ9QWV1 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-OaQ9QWV1 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-OaQ9QWV1 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-OaQ9QWV1 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-OaQ9QWV1 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-OaQ9QWV1 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-OaQ9QWV1 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-OaQ9QWV1 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-OaQ9QWV1 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-OaQ9QWV1 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-OaQ9QWV1 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-OaQ9QWV1 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-OaQ9QWV1 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-OaQ9QWV1 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-OaQ9QWV1 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-OaQ9QWV1 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-OaQ9QWV1 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-OaQ9QWV1 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-OaQ9QWV1 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-OaQ9QWV1 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-OaQ9QWV1 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-OaQ9QWV1 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-OaQ9QWV1 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-OaQ9QWV1 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-OaQ9QWV1 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-OaQ9QWV1 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-OaQ9QWV1 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-OaQ9QWV1 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-OaQ9QWV1 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-OaQ9QWV1 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-OaQ9QWV1 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-OaQ9QWV1 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-OaQ9QWV1 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-OaQ9QWV1 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-OaQ9QWV1 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-OaQ9QWV1 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-OaQ9QWV1 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-OaQ9QWV1 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-OaQ9QWV1 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-OaQ9QWV1 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-OaQ9QWV1 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-OaQ9QWV1 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-OaQ9QWV1 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-OaQ9QWV1 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-OaQ9QWV1 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-OaQ9QWV1 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-OaQ9QWV1 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-OaQ9QWV1 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-OaQ9QWV1 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-OaQ9QWV1 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-OaQ9QWV1 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-OaQ9QWV1 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-OaQ9QWV1 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-OaQ9QWV1 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-OaQ9QWV1 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-OaQ9QWV1 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-OaQ9QWV1 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-OaQ9QWV1 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-OaQ9QWV1 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-OaQ9QWV1 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-OaQ9QWV1 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-OaQ9QWV1 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-OaQ9QWV1 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-OaQ9QWV1 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-OaQ9QWV1 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-OaQ9QWV1 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-OaQ9QWV1 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-OaQ9QWV1 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-OaQ9QWV1 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-OaQ9QWV1 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-OaQ9QWV1 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-OaQ9QWV1 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-OaQ9QWV1 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-OaQ9QWV1 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-OaQ9QWV1 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-OaQ9QWV1 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-OaQ9QWV1 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-OaQ9QWV1 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-OaQ9QWV1 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-OaQ9QWV1 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-OaQ9QWV1 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-OaQ9QWV1 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-OaQ9QWV1 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms