Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Rabgef1Q9JM13 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rabgef1Q9JM13 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rabgef1Q9JM13 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Rabgef1Q9JM13 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rabgef1Q9JM13 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rabgef1Q9JM13 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rabgef1Q9JM13 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Rabgef1Q9JM13 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rabgef1Q9JM13 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rabgef1Q9JM13 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rabgef1Q9JM13 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Rabgef1Q9JM13 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rabgef1Q9JM13 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Rabgef1Q9JM13 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Rabgef1Q9JM13 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rabgef1Q9JM13 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Rabgef1Q9JM13 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rabgef1Q9JM13 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rabgef1Q9JM13 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rabgef1Q9JM13 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Rabgef1Q9JM13 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rabgef1Q9JM13 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Rabgef1Q9JM13 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rabgef1Q9JM13 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rabgef1Q9JM13 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rabgef1Q9JM13 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rabgef1Q9JM13 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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