Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLG4

Pkd2l2, Polycystic kidney disease 2-like 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l2Q9JLG4 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pkd2l2Q9JLG4 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pkd2l2Q9JLG4 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pkd2l2Q9JLG4 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pkd2l2Q9JLG4 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Pkd2l2Q9JLG4 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pkd2l2Q9JLG4 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pkd2l2Q9JLG4 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pkd2l2Q9JLG4 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pkd2l2Q9JLG4 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pkd2l2Q9JLG4 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pkd2l2Q9JLG4 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pkd2l2Q9JLG4 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pkd2l2Q9JLG4 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pkd2l2Q9JLG4 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Pkd2l2Q9JLG4 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Pkd2l2Q9JLG4 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pkd2l2Q9JLG4 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pkd2l2Q9JLG4 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pkd2l2Q9JLG4 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pkd2l2Q9JLG4 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pkd2l2Q9JLG4 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pkd2l2Q9JLG4 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Pkd2l2Q9JLG4 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pkd2l2Q9JLG4 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pkd2l2Q9JLG4 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pkd2l2Q9JLG4 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pkd2l2Q9JLG4 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pkd2l2Q9JLG4 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pkd2l2Q9JLG4 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pkd2l2Q9JLG4 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pkd2l2Q9JLG4 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pkd2l2Q9JLG4 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Pkd2l2Q9JLG4 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pkd2l2Q9JLG4 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pkd2l2Q9JLG4 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pkd2l2Q9JLG4 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pkd2l2Q9JLG4 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pkd2l2Q9JLG4 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pkd2l2Q9JLG4 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Pkd2l2Q9JLG4 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Pkd2l2Q9JLG4 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Pkd2l2Q9JLG4 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pkd2l2Q9JLG4 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pkd2l2Q9JLG4 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pkd2l2Q9JLG4 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pkd2l2Q9JLG4 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Pkd2l2Q9JLG4 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pkd2l2Q9JLG4 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pkd2l2Q9JLG4 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pkd2l2Q9JLG4 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pkd2l2Q9JLG4 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pkd2l2Q9JLG4 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pkd2l2Q9JLG4 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pkd2l2Q9JLG4 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pkd2l2Q9JLG4 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pkd2l2Q9JLG4 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pkd2l2Q9JLG4 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pkd2l2Q9JLG4 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Pkd2l2Q9JLG4 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pkd2l2Q9JLG4 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pkd2l2Q9JLG4 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Pkd2l2Q9JLG4 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Pkd2l2Q9JLG4 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pkd2l2Q9JLG4 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.5 ms