Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB9

Nectin3, Nectin-3, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin3Q9JLB9 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Nectin3Q9JLB9 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Nectin3Q9JLB9 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Nectin3Q9JLB9 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Nectin3Q9JLB9 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Nectin3Q9JLB9 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Nectin3Q9JLB9 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Nectin3Q9JLB9 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Nectin3Q9JLB9 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Nectin3Q9JLB9 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Nectin3Q9JLB9 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Nectin3Q9JLB9 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Nectin3Q9JLB9 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nectin3Q9JLB9 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nectin3Q9JLB9 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nectin3Q9JLB9 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nectin3Q9JLB9 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nectin3Q9JLB9 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nectin3Q9JLB9 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nectin3Q9JLB9 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Nectin3Q9JLB9 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nectin3Q9JLB9 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nectin3Q9JLB9 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nectin3Q9JLB9 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nectin3Q9JLB9 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nectin3Q9JLB9 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Nectin3Q9JLB9 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nectin3Q9JLB9 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Nectin3Q9JLB9 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nectin3Q9JLB9 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nectin3Q9JLB9 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Nectin3Q9JLB9 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nectin3Q9JLB9 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nectin3Q9JLB9 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nectin3Q9JLB9 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nectin3Q9JLB9 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nectin3Q9JLB9 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nectin3Q9JLB9 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nectin3Q9JLB9 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nectin3Q9JLB9 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nectin3Q9JLB9 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nectin3Q9JLB9 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Nectin3Q9JLB9 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nectin3Q9JLB9 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nectin3Q9JLB9 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nectin3Q9JLB9 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nectin3Q9JLB9 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nectin3Q9JLB9 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Nectin3Q9JLB9 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Nectin3Q9JLB9 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Nectin3Q9JLB9 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nectin3Q9JLB9 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nectin3Q9JLB9 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nectin3Q9JLB9 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nectin3Q9JLB9 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nectin3Q9JLB9 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nectin3Q9JLB9 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nectin3Q9JLB9 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Nectin3Q9JLB9 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nectin3Q9JLB9 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nectin3Q9JLB9 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Nectin3Q9JLB9 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nectin3Q9JLB9 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nectin3Q9JLB9 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nectin3Q9JLB9 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nectin3Q9JLB9 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nectin3Q9JLB9 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nectin3Q9JLB9 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nectin3Q9JLB9 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nectin3Q9JLB9 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nectin3Q9JLB9 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nectin3Q9JLB9 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nectin3Q9JLB9 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nectin3Q9JLB9 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nectin3Q9JLB9 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nectin3Q9JLB9 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nectin3Q9JLB9 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nectin3Q9JLB9 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nectin3Q9JLB9 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nectin3Q9JLB9 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nectin3Q9JLB9 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nectin3Q9JLB9 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nectin3Q9JLB9 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nectin3Q9JLB9 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Nectin3Q9JLB9 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nectin3Q9JLB9 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Nectin3Q9JLB9 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nectin3Q9JLB9 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nectin3Q9JLB9 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Nectin3Q9JLB9 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Nectin3Q9JLB9 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nectin3Q9JLB9 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nectin3Q9JLB9 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nectin3Q9JLB9 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nectin3Q9JLB9 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nectin3Q9JLB9 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nectin3Q9JLB9 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nectin3Q9JLB9 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nectin3Q9JLB9 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nectin3Q9JLB9 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms