Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL95

Prg3, Proteoglycan 3, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prg3Q9JL95 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prg3Q9JL95 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prg3Q9JL95 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prg3Q9JL95 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Prg3Q9JL95 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prg3Q9JL95 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prg3Q9JL95 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prg3Q9JL95 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prg3Q9JL95 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prg3Q9JL95 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prg3Q9JL95 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prg3Q9JL95 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prg3Q9JL95 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prg3Q9JL95 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prg3Q9JL95 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prg3Q9JL95 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Prg3Q9JL95 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prg3Q9JL95 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Prg3Q9JL95 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prg3Q9JL95 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prg3Q9JL95 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Prg3Q9JL95 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prg3Q9JL95 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prg3Q9JL95 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prg3Q9JL95 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prg3Q9JL95 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prg3Q9JL95 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prg3Q9JL95 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Prg3Q9JL95 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Prg3Q9JL95 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Prg3Q9JL95 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Prg3Q9JL95 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prg3Q9JL95 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prg3Q9JL95 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prg3Q9JL95 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prg3Q9JL95 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prg3Q9JL95 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prg3Q9JL95 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prg3Q9JL95 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prg3Q9JL95 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prg3Q9JL95 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prg3Q9JL95 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prg3Q9JL95 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prg3Q9JL95 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prg3Q9JL95 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Prg3Q9JL95 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prg3Q9JL95 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms