Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ9

Cngb3, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-3, mousemouse

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cngb3Q9JJZ9 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cngb3Q9JJZ9 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cngb3Q9JJZ9 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Cngb3Q9JJZ9 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cngb3Q9JJZ9 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cngb3Q9JJZ9 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cngb3Q9JJZ9 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cngb3Q9JJZ9 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cngb3Q9JJZ9 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cngb3Q9JJZ9 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cngb3Q9JJZ9 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cngb3Q9JJZ9 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cngb3Q9JJZ9 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cngb3Q9JJZ9 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cngb3Q9JJZ9 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cngb3Q9JJZ9 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cngb3Q9JJZ9 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cngb3Q9JJZ9 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cngb3Q9JJZ9 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cngb3Q9JJZ9 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cngb3Q9JJZ9 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Cngb3Q9JJZ9 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cngb3Q9JJZ9 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cngb3Q9JJZ9 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cngb3Q9JJZ9 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cngb3Q9JJZ9 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Cngb3Q9JJZ9 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cngb3Q9JJZ9 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cngb3Q9JJZ9 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cngb3Q9JJZ9 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Cngb3Q9JJZ9 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cngb3Q9JJZ9 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cngb3Q9JJZ9 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cngb3Q9JJZ9 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cngb3Q9JJZ9 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cngb3Q9JJZ9 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cngb3Q9JJZ9 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cngb3Q9JJZ9 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cngb3Q9JJZ9 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cngb3Q9JJZ9 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cngb3Q9JJZ9 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cngb3Q9JJZ9 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cngb3Q9JJZ9 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cngb3Q9JJZ9 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cngb3Q9JJZ9 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Cngb3Q9JJZ9 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cngb3Q9JJZ9 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cngb3Q9JJZ9 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cngb3Q9JJZ9 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cngb3Q9JJZ9 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cngb3Q9JJZ9 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cngb3Q9JJZ9 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cngb3Q9JJZ9 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cngb3Q9JJZ9 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Cngb3Q9JJZ9 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cngb3Q9JJZ9 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cngb3Q9JJZ9 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cngb3Q9JJZ9 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cngb3Q9JJZ9 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cngb3Q9JJZ9 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cngb3Q9JJZ9 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cngb3Q9JJZ9 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cngb3Q9JJZ9 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cngb3Q9JJZ9 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cngb3Q9JJZ9 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cngb3Q9JJZ9 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cngb3Q9JJZ9 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cngb3Q9JJZ9 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cngb3Q9JJZ9 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cngb3Q9JJZ9 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cngb3Q9JJZ9 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cngb3Q9JJZ9 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cngb3Q9JJZ9 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cngb3Q9JJZ9 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cngb3Q9JJZ9 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cngb3Q9JJZ9 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cngb3Q9JJZ9 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cngb3Q9JJZ9 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cngb3Q9JJZ9 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Cngb3Q9JJZ9 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cngb3Q9JJZ9 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Cngb3Q9JJZ9 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cngb3Q9JJZ9 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cngb3Q9JJZ9 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cngb3Q9JJZ9 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cngb3Q9JJZ9 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cngb3Q9JJZ9 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cngb3Q9JJZ9 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cngb3Q9JJZ9 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cngb3Q9JJZ9 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cngb3Q9JJZ9 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cngb3Q9JJZ9 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cngb3Q9JJZ9 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cngb3Q9JJZ9 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cngb3Q9JJZ9 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cngb3Q9JJZ9 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cngb3Q9JJZ9 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cngb3Q9JJZ9 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cngb3Q9JJZ9 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cngb3Q9JJZ9 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms