Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI70

Mkks, McKusick-Kaufman/Bardet-Biedl syndromes putative chaperonin, mousemouse

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MkksQ9JI70 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MkksQ9JI70 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MkksQ9JI70 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MkksQ9JI70 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MkksQ9JI70 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MkksQ9JI70 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MkksQ9JI70 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MkksQ9JI70 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MkksQ9JI70 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MkksQ9JI70 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MkksQ9JI70 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MkksQ9JI70 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MkksQ9JI70 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MkksQ9JI70 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MkksQ9JI70 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MkksQ9JI70 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MkksQ9JI70 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MkksQ9JI70 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MkksQ9JI70 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MkksQ9JI70 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MkksQ9JI70 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
MkksQ9JI70 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MkksQ9JI70 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MkksQ9JI70 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MkksQ9JI70 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MkksQ9JI70 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MkksQ9JI70 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MkksQ9JI70 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MkksQ9JI70 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MkksQ9JI70 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MkksQ9JI70 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MkksQ9JI70 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MkksQ9JI70 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MkksQ9JI70 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MkksQ9JI70 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MkksQ9JI70 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MkksQ9JI70 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MkksQ9JI70 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MkksQ9JI70 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MkksQ9JI70 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MkksQ9JI70 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MkksQ9JI70 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MkksQ9JI70 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MkksQ9JI70 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MkksQ9JI70 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MkksQ9JI70 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MkksQ9JI70 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MkksQ9JI70 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MkksQ9JI70 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MkksQ9JI70 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MkksQ9JI70 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MkksQ9JI70 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MkksQ9JI70 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MkksQ9JI70 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MkksQ9JI70 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MkksQ9JI70 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
MkksQ9JI70 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MkksQ9JI70 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MkksQ9JI70 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
MkksQ9JI70 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MkksQ9JI70 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MkksQ9JI70 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MkksQ9JI70 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MkksQ9JI70 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
MkksQ9JI70 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MkksQ9JI70 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MkksQ9JI70 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MkksQ9JI70 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MkksQ9JI70 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MkksQ9JI70 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MkksQ9JI70 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MkksQ9JI70 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MkksQ9JI70 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MkksQ9JI70 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MkksQ9JI70 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MkksQ9JI70 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MkksQ9JI70 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MkksQ9JI70 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MkksQ9JI70 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MkksQ9JI70 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MkksQ9JI70 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MkksQ9JI70 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MkksQ9JI70 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MkksQ9JI70 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MkksQ9JI70 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MkksQ9JI70 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MkksQ9JI70 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
MkksQ9JI70 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MkksQ9JI70 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MkksQ9JI70 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
MkksQ9JI70 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MkksQ9JI70 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MkksQ9JI70 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MkksQ9JI70 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MkksQ9JI70 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
MkksQ9JI70 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
MkksQ9JI70 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
MkksQ9JI70 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
MkksQ9JI70 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
MkksQ9JI70 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.9 ms