Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESW8

Pgpep1, Pyroglutamyl-peptidase 1, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pgpep1Q9ESW8 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pgpep1Q9ESW8 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pgpep1Q9ESW8 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pgpep1Q9ESW8 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pgpep1Q9ESW8 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pgpep1Q9ESW8 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pgpep1Q9ESW8 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pgpep1Q9ESW8 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pgpep1Q9ESW8 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pgpep1Q9ESW8 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pgpep1Q9ESW8 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pgpep1Q9ESW8 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pgpep1Q9ESW8 4933403O08Rik-201ENSMUST00000132037 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pgpep1Q9ESW8 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pgpep1Q9ESW8 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Pgpep1Q9ESW8 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Pgpep1Q9ESW8 Gm37436-201ENSMUST00000193842 1085 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Pgpep1Q9ESW8 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pgpep1Q9ESW8 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pgpep1Q9ESW8 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pgpep1Q9ESW8 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pgpep1Q9ESW8 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pgpep1Q9ESW8 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pgpep1Q9ESW8 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pgpep1Q9ESW8 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pgpep1Q9ESW8 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pgpep1Q9ESW8 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pgpep1Q9ESW8 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pgpep1Q9ESW8 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pgpep1Q9ESW8 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pgpep1Q9ESW8 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pgpep1Q9ESW8 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pgpep1Q9ESW8 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pgpep1Q9ESW8 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Pgpep1Q9ESW8 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pgpep1Q9ESW8 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pgpep1Q9ESW8 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Pgpep1Q9ESW8 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pgpep1Q9ESW8 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pgpep1Q9ESW8 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pgpep1Q9ESW8 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pgpep1Q9ESW8 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pgpep1Q9ESW8 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pgpep1Q9ESW8 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pgpep1Q9ESW8 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pgpep1Q9ESW8 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pgpep1Q9ESW8 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pgpep1Q9ESW8 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pgpep1Q9ESW8 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pgpep1Q9ESW8 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pgpep1Q9ESW8 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pgpep1Q9ESW8 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pgpep1Q9ESW8 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pgpep1Q9ESW8 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pgpep1Q9ESW8 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pgpep1Q9ESW8 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pgpep1Q9ESW8 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pgpep1Q9ESW8 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Pgpep1Q9ESW8 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pgpep1Q9ESW8 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pgpep1Q9ESW8 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pgpep1Q9ESW8 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Pgpep1Q9ESW8 AC155266.1-201ENSMUST00000220762 904 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Pgpep1Q9ESW8 AU017674-201ENSMUST00000222864 720 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pgpep1Q9ESW8 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pgpep1Q9ESW8 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pgpep1Q9ESW8 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pgpep1Q9ESW8 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pgpep1Q9ESW8 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pgpep1Q9ESW8 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pgpep1Q9ESW8 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pgpep1Q9ESW8 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pgpep1Q9ESW8 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pgpep1Q9ESW8 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pgpep1Q9ESW8 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pgpep1Q9ESW8 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pgpep1Q9ESW8 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pgpep1Q9ESW8 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pgpep1Q9ESW8 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pgpep1Q9ESW8 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pgpep1Q9ESW8 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pgpep1Q9ESW8 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pgpep1Q9ESW8 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pgpep1Q9ESW8 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pgpep1Q9ESW8 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pgpep1Q9ESW8 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Pgpep1Q9ESW8 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pgpep1Q9ESW8 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pgpep1Q9ESW8 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pgpep1Q9ESW8 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pgpep1Q9ESW8 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pgpep1Q9ESW8 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pgpep1Q9ESW8 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pgpep1Q9ESW8 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pgpep1Q9ESW8 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pgpep1Q9ESW8 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pgpep1Q9ESW8 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pgpep1Q9ESW8 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pgpep1Q9ESW8 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Pgpep1Q9ESW8 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms