Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES46

Parvb, Beta-parvin, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ParvbQ9ES46 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ParvbQ9ES46 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ParvbQ9ES46 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ParvbQ9ES46 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ParvbQ9ES46 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ParvbQ9ES46 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ParvbQ9ES46 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ParvbQ9ES46 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ParvbQ9ES46 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ParvbQ9ES46 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ParvbQ9ES46 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ParvbQ9ES46 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ParvbQ9ES46 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ParvbQ9ES46 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ParvbQ9ES46 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ParvbQ9ES46 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ParvbQ9ES46 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ParvbQ9ES46 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ParvbQ9ES46 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ParvbQ9ES46 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ParvbQ9ES46 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ParvbQ9ES46 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ParvbQ9ES46 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ParvbQ9ES46 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ParvbQ9ES46 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ParvbQ9ES46 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ParvbQ9ES46 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ParvbQ9ES46 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ParvbQ9ES46 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ParvbQ9ES46 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ParvbQ9ES46 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ParvbQ9ES46 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ParvbQ9ES46 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ParvbQ9ES46 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ParvbQ9ES46 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ParvbQ9ES46 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ParvbQ9ES46 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ParvbQ9ES46 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ParvbQ9ES46 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ParvbQ9ES46 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ParvbQ9ES46 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ParvbQ9ES46 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ParvbQ9ES46 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ParvbQ9ES46 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ParvbQ9ES46 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ParvbQ9ES46 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ParvbQ9ES46 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ParvbQ9ES46 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ParvbQ9ES46 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ParvbQ9ES46 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ParvbQ9ES46 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ParvbQ9ES46 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ParvbQ9ES46 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ParvbQ9ES46 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ParvbQ9ES46 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ParvbQ9ES46 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ParvbQ9ES46 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ParvbQ9ES46 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ParvbQ9ES46 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ParvbQ9ES46 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ParvbQ9ES46 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ParvbQ9ES46 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ParvbQ9ES46 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ParvbQ9ES46 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ParvbQ9ES46 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ParvbQ9ES46 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ParvbQ9ES46 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ParvbQ9ES46 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ParvbQ9ES46 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ParvbQ9ES46 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ParvbQ9ES46 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ParvbQ9ES46 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ParvbQ9ES46 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ParvbQ9ES46 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ParvbQ9ES46 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ParvbQ9ES46 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ParvbQ9ES46 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ParvbQ9ES46 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ParvbQ9ES46 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ParvbQ9ES46 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ParvbQ9ES46 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ParvbQ9ES46 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ParvbQ9ES46 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ParvbQ9ES46 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ParvbQ9ES46 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ParvbQ9ES46 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ParvbQ9ES46 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ParvbQ9ES46 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ParvbQ9ES46 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ParvbQ9ES46 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ParvbQ9ES46 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ParvbQ9ES46 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ParvbQ9ES46 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ParvbQ9ES46 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ParvbQ9ES46 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ParvbQ9ES46 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ParvbQ9ES46 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ParvbQ9ES46 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ParvbQ9ES46 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ParvbQ9ES46 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms