Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERF3

Wdr61, WD repeat-containing protein 61, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr61Q9ERF3 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Wdr61Q9ERF3 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Wdr61Q9ERF3 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Wdr61Q9ERF3 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Wdr61Q9ERF3 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Wdr61Q9ERF3 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Wdr61Q9ERF3 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Wdr61Q9ERF3 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Wdr61Q9ERF3 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Wdr61Q9ERF3 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Wdr61Q9ERF3 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Wdr61Q9ERF3 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Wdr61Q9ERF3 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Wdr61Q9ERF3 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Wdr61Q9ERF3 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Wdr61Q9ERF3 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Wdr61Q9ERF3 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Wdr61Q9ERF3 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Wdr61Q9ERF3 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Wdr61Q9ERF3 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Wdr61Q9ERF3 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Wdr61Q9ERF3 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Wdr61Q9ERF3 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Wdr61Q9ERF3 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Wdr61Q9ERF3 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Wdr61Q9ERF3 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Wdr61Q9ERF3 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Wdr61Q9ERF3 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Wdr61Q9ERF3 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Wdr61Q9ERF3 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Wdr61Q9ERF3 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Wdr61Q9ERF3 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Wdr61Q9ERF3 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Wdr61Q9ERF3 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Wdr61Q9ERF3 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Wdr61Q9ERF3 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Wdr61Q9ERF3 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Wdr61Q9ERF3 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Wdr61Q9ERF3 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Wdr61Q9ERF3 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Wdr61Q9ERF3 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Wdr61Q9ERF3 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Wdr61Q9ERF3 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Wdr61Q9ERF3 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Wdr61Q9ERF3 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Wdr61Q9ERF3 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Wdr61Q9ERF3 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Wdr61Q9ERF3 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Wdr61Q9ERF3 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Wdr61Q9ERF3 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Wdr61Q9ERF3 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Wdr61Q9ERF3 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Wdr61Q9ERF3 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Wdr61Q9ERF3 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Wdr61Q9ERF3 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Wdr61Q9ERF3 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Wdr61Q9ERF3 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Wdr61Q9ERF3 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Wdr61Q9ERF3 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Wdr61Q9ERF3 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Wdr61Q9ERF3 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Wdr61Q9ERF3 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Wdr61Q9ERF3 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Wdr61Q9ERF3 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Wdr61Q9ERF3 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Wdr61Q9ERF3 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Wdr61Q9ERF3 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Wdr61Q9ERF3 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Wdr61Q9ERF3 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Wdr61Q9ERF3 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Wdr61Q9ERF3 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Wdr61Q9ERF3 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Wdr61Q9ERF3 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Wdr61Q9ERF3 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Wdr61Q9ERF3 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Wdr61Q9ERF3 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Wdr61Q9ERF3 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Wdr61Q9ERF3 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Wdr61Q9ERF3 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Wdr61Q9ERF3 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Wdr61Q9ERF3 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Wdr61Q9ERF3 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Wdr61Q9ERF3 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Wdr61Q9ERF3 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Wdr61Q9ERF3 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Wdr61Q9ERF3 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Wdr61Q9ERF3 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Wdr61Q9ERF3 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Wdr61Q9ERF3 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Wdr61Q9ERF3 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Wdr61Q9ERF3 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Wdr61Q9ERF3 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Wdr61Q9ERF3 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Wdr61Q9ERF3 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Wdr61Q9ERF3 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Wdr61Q9ERF3 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Wdr61Q9ERF3 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Wdr61Q9ERF3 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Wdr61Q9ERF3 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Wdr61Q9ERF3 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms