Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Rnf6Q9DBU5 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf6Q9DBU5 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf6Q9DBU5 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf6Q9DBU5 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf6Q9DBU5 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf6Q9DBU5 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf6Q9DBU5 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf6Q9DBU5 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf6Q9DBU5 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf6Q9DBU5 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf6Q9DBU5 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf6Q9DBU5 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf6Q9DBU5 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf6Q9DBU5 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf6Q9DBU5 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf6Q9DBU5 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf6Q9DBU5 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf6Q9DBU5 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf6Q9DBU5 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf6Q9DBU5 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf6Q9DBU5 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf6Q9DBU5 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf6Q9DBU5 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf6Q9DBU5 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf6Q9DBU5 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf6Q9DBU5 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf6Q9DBU5 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Rnf6Q9DBU5 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf6Q9DBU5 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf6Q9DBU5 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf6Q9DBU5 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf6Q9DBU5 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Rnf6Q9DBU5 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf6Q9DBU5 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf6Q9DBU5 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf6Q9DBU5 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf6Q9DBU5 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Rnf6Q9DBU5 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf6Q9DBU5 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Rnf6Q9DBU5 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf6Q9DBU5 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf6Q9DBU5 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf6Q9DBU5 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf6Q9DBU5 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf6Q9DBU5 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf6Q9DBU5 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf6Q9DBU5 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf6Q9DBU5 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf6Q9DBU5 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf6Q9DBU5 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf6Q9DBU5 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf6Q9DBU5 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf6Q9DBU5 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf6Q9DBU5 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Rnf6Q9DBU5 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf6Q9DBU5 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf6Q9DBU5 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf6Q9DBU5 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf6Q9DBU5 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf6Q9DBU5 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf6Q9DBU5 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf6Q9DBU5 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf6Q9DBU5 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf6Q9DBU5 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf6Q9DBU5 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf6Q9DBU5 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf6Q9DBU5 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf6Q9DBU5 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf6Q9DBU5 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf6Q9DBU5 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf6Q9DBU5 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf6Q9DBU5 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf6Q9DBU5 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf6Q9DBU5 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf6Q9DBU5 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf6Q9DBU5 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf6Q9DBU5 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf6Q9DBU5 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf6Q9DBU5 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf6Q9DBU5 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
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