Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB16

Cab39l, Calcium-binding protein 39-like, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39lQ9DB16 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cab39lQ9DB16 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cab39lQ9DB16 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cab39lQ9DB16 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cab39lQ9DB16 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cab39lQ9DB16 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cab39lQ9DB16 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cab39lQ9DB16 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Cab39lQ9DB16 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cab39lQ9DB16 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cab39lQ9DB16 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cab39lQ9DB16 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cab39lQ9DB16 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cab39lQ9DB16 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cab39lQ9DB16 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Cab39lQ9DB16 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cab39lQ9DB16 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cab39lQ9DB16 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cab39lQ9DB16 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cab39lQ9DB16 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cab39lQ9DB16 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cab39lQ9DB16 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cab39lQ9DB16 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cab39lQ9DB16 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cab39lQ9DB16 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cab39lQ9DB16 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cab39lQ9DB16 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cab39lQ9DB16 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cab39lQ9DB16 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cab39lQ9DB16 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cab39lQ9DB16 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cab39lQ9DB16 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cab39lQ9DB16 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cab39lQ9DB16 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cab39lQ9DB16 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cab39lQ9DB16 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cab39lQ9DB16 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cab39lQ9DB16 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cab39lQ9DB16 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cab39lQ9DB16 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cab39lQ9DB16 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Cab39lQ9DB16 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cab39lQ9DB16 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Cab39lQ9DB16 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
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Cab39lQ9DB16 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cab39lQ9DB16 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cab39lQ9DB16 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cab39lQ9DB16 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cab39lQ9DB16 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cab39lQ9DB16 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Cab39lQ9DB16 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cab39lQ9DB16 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cab39lQ9DB16 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cab39lQ9DB16 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cab39lQ9DB16 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cab39lQ9DB16 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cab39lQ9DB16 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cab39lQ9DB16 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cab39lQ9DB16 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cab39lQ9DB16 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Cab39lQ9DB16 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cab39lQ9DB16 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Cab39lQ9DB16 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cab39lQ9DB16 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cab39lQ9DB16 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cab39lQ9DB16 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cab39lQ9DB16 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cab39lQ9DB16 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cab39lQ9DB16 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cab39lQ9DB16 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cab39lQ9DB16 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cab39lQ9DB16 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cab39lQ9DB16 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Cab39lQ9DB16 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cab39lQ9DB16 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Cab39lQ9DB16 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cab39lQ9DB16 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cab39lQ9DB16 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cab39lQ9DB16 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cab39lQ9DB16 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cab39lQ9DB16 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cab39lQ9DB16 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cab39lQ9DB16 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cab39lQ9DB16 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cab39lQ9DB16 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cab39lQ9DB16 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cab39lQ9DB16 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cab39lQ9DB16 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cab39lQ9DB16 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cab39lQ9DB16 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cab39lQ9DB16 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cab39lQ9DB16 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cab39lQ9DB16 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cab39lQ9DB16 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cab39lQ9DB16 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms