Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAW6

Prpf4, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf4Q9DAW6 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prpf4Q9DAW6 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prpf4Q9DAW6 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prpf4Q9DAW6 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prpf4Q9DAW6 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prpf4Q9DAW6 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prpf4Q9DAW6 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prpf4Q9DAW6 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prpf4Q9DAW6 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prpf4Q9DAW6 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prpf4Q9DAW6 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prpf4Q9DAW6 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prpf4Q9DAW6 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prpf4Q9DAW6 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prpf4Q9DAW6 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Prpf4Q9DAW6 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prpf4Q9DAW6 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prpf4Q9DAW6 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prpf4Q9DAW6 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prpf4Q9DAW6 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prpf4Q9DAW6 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prpf4Q9DAW6 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prpf4Q9DAW6 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prpf4Q9DAW6 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prpf4Q9DAW6 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prpf4Q9DAW6 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prpf4Q9DAW6 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prpf4Q9DAW6 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prpf4Q9DAW6 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prpf4Q9DAW6 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Prpf4Q9DAW6 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prpf4Q9DAW6 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prpf4Q9DAW6 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prpf4Q9DAW6 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prpf4Q9DAW6 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prpf4Q9DAW6 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prpf4Q9DAW6 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prpf4Q9DAW6 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prpf4Q9DAW6 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prpf4Q9DAW6 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prpf4Q9DAW6 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prpf4Q9DAW6 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prpf4Q9DAW6 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prpf4Q9DAW6 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prpf4Q9DAW6 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prpf4Q9DAW6 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prpf4Q9DAW6 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Prpf4Q9DAW6 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prpf4Q9DAW6 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prpf4Q9DAW6 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prpf4Q9DAW6 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prpf4Q9DAW6 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prpf4Q9DAW6 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prpf4Q9DAW6 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prpf4Q9DAW6 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prpf4Q9DAW6 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prpf4Q9DAW6 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prpf4Q9DAW6 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prpf4Q9DAW6 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prpf4Q9DAW6 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prpf4Q9DAW6 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prpf4Q9DAW6 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prpf4Q9DAW6 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prpf4Q9DAW6 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prpf4Q9DAW6 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prpf4Q9DAW6 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prpf4Q9DAW6 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Prpf4Q9DAW6 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prpf4Q9DAW6 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prpf4Q9DAW6 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prpf4Q9DAW6 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prpf4Q9DAW6 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prpf4Q9DAW6 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prpf4Q9DAW6 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prpf4Q9DAW6 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prpf4Q9DAW6 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prpf4Q9DAW6 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prpf4Q9DAW6 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prpf4Q9DAW6 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prpf4Q9DAW6 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prpf4Q9DAW6 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prpf4Q9DAW6 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prpf4Q9DAW6 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prpf4Q9DAW6 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prpf4Q9DAW6 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prpf4Q9DAW6 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prpf4Q9DAW6 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prpf4Q9DAW6 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prpf4Q9DAW6 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prpf4Q9DAW6 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prpf4Q9DAW6 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prpf4Q9DAW6 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prpf4Q9DAW6 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prpf4Q9DAW6 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prpf4Q9DAW6 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prpf4Q9DAW6 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prpf4Q9DAW6 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prpf4Q9DAW6 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prpf4Q9DAW6 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prpf4Q9DAW6 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms