Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA47

Tmem239, Transmembrane protein 239, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem239Q9DA47 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmem239Q9DA47 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmem239Q9DA47 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmem239Q9DA47 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmem239Q9DA47 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmem239Q9DA47 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmem239Q9DA47 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmem239Q9DA47 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmem239Q9DA47 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmem239Q9DA47 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmem239Q9DA47 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmem239Q9DA47 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmem239Q9DA47 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmem239Q9DA47 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmem239Q9DA47 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmem239Q9DA47 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmem239Q9DA47 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmem239Q9DA47 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmem239Q9DA47 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmem239Q9DA47 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmem239Q9DA47 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmem239Q9DA47 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmem239Q9DA47 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmem239Q9DA47 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmem239Q9DA47 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmem239Q9DA47 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmem239Q9DA47 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmem239Q9DA47 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmem239Q9DA47 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmem239Q9DA47 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmem239Q9DA47 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmem239Q9DA47 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmem239Q9DA47 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmem239Q9DA47 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmem239Q9DA47 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmem239Q9DA47 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmem239Q9DA47 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmem239Q9DA47 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmem239Q9DA47 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmem239Q9DA47 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmem239Q9DA47 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmem239Q9DA47 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmem239Q9DA47 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmem239Q9DA47 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmem239Q9DA47 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tmem239Q9DA47 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmem239Q9DA47 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmem239Q9DA47 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmem239Q9DA47 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmem239Q9DA47 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmem239Q9DA47 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmem239Q9DA47 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmem239Q9DA47 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmem239Q9DA47 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmem239Q9DA47 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmem239Q9DA47 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmem239Q9DA47 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmem239Q9DA47 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmem239Q9DA47 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmem239Q9DA47 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmem239Q9DA47 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmem239Q9DA47 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmem239Q9DA47 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmem239Q9DA47 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmem239Q9DA47 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmem239Q9DA47 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmem239Q9DA47 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmem239Q9DA47 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmem239Q9DA47 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmem239Q9DA47 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmem239Q9DA47 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmem239Q9DA47 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmem239Q9DA47 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmem239Q9DA47 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmem239Q9DA47 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmem239Q9DA47 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmem239Q9DA47 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmem239Q9DA47 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmem239Q9DA47 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmem239Q9DA47 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmem239Q9DA47 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmem239Q9DA47 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmem239Q9DA47 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmem239Q9DA47 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmem239Q9DA47 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmem239Q9DA47 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmem239Q9DA47 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tmem239Q9DA47 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Tmem239Q9DA47 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Tmem239Q9DA47 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Tmem239Q9DA47 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Tmem239Q9DA47 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Tmem239Q9DA47 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmem239Q9DA47 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmem239Q9DA47 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmem239Q9DA47 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmem239Q9DA47 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmem239Q9DA47 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmem239Q9DA47 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tmem239Q9DA47 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms