Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8E6

Rpl4, 60S ribosomal protein L4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl4Q9D8E6 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl4Q9D8E6 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl4Q9D8E6 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl4Q9D8E6 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl4Q9D8E6 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl4Q9D8E6 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl4Q9D8E6 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl4Q9D8E6 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl4Q9D8E6 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl4Q9D8E6 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl4Q9D8E6 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl4Q9D8E6 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl4Q9D8E6 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rpl4Q9D8E6 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl4Q9D8E6 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl4Q9D8E6 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl4Q9D8E6 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl4Q9D8E6 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl4Q9D8E6 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl4Q9D8E6 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl4Q9D8E6 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl4Q9D8E6 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl4Q9D8E6 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl4Q9D8E6 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl4Q9D8E6 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl4Q9D8E6 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl4Q9D8E6 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl4Q9D8E6 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl4Q9D8E6 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl4Q9D8E6 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl4Q9D8E6 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl4Q9D8E6 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl4Q9D8E6 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl4Q9D8E6 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl4Q9D8E6 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl4Q9D8E6 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl4Q9D8E6 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl4Q9D8E6 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl4Q9D8E6 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl4Q9D8E6 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl4Q9D8E6 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl4Q9D8E6 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl4Q9D8E6 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpl4Q9D8E6 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl4Q9D8E6 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl4Q9D8E6 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl4Q9D8E6 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl4Q9D8E6 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl4Q9D8E6 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl4Q9D8E6 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl4Q9D8E6 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl4Q9D8E6 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl4Q9D8E6 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl4Q9D8E6 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl4Q9D8E6 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl4Q9D8E6 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl4Q9D8E6 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl4Q9D8E6 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl4Q9D8E6 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl4Q9D8E6 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl4Q9D8E6 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl4Q9D8E6 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl4Q9D8E6 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl4Q9D8E6 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl4Q9D8E6 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl4Q9D8E6 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl4Q9D8E6 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl4Q9D8E6 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl4Q9D8E6 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl4Q9D8E6 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl4Q9D8E6 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl4Q9D8E6 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl4Q9D8E6 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpl4Q9D8E6 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl4Q9D8E6 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl4Q9D8E6 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl4Q9D8E6 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl4Q9D8E6 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl4Q9D8E6 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl4Q9D8E6 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl4Q9D8E6 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl4Q9D8E6 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl4Q9D8E6 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl4Q9D8E6 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl4Q9D8E6 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl4Q9D8E6 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl4Q9D8E6 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl4Q9D8E6 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl4Q9D8E6 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl4Q9D8E6 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl4Q9D8E6 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl4Q9D8E6 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl4Q9D8E6 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl4Q9D8E6 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl4Q9D8E6 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl4Q9D8E6 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl4Q9D8E6 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl4Q9D8E6 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl4Q9D8E6 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpl4Q9D8E6 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms