Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B7

Jam3, Junctional adhesion molecule C, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jam3Q9D8B7 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Jam3Q9D8B7 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Jam3Q9D8B7 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Jam3Q9D8B7 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Jam3Q9D8B7 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Jam3Q9D8B7 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Jam3Q9D8B7 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Jam3Q9D8B7 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Jam3Q9D8B7 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Jam3Q9D8B7 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Jam3Q9D8B7 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Jam3Q9D8B7 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Jam3Q9D8B7 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Jam3Q9D8B7 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Jam3Q9D8B7 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Jam3Q9D8B7 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Jam3Q9D8B7 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Jam3Q9D8B7 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Jam3Q9D8B7 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Jam3Q9D8B7 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Jam3Q9D8B7 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Jam3Q9D8B7 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Jam3Q9D8B7 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Jam3Q9D8B7 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Jam3Q9D8B7 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Jam3Q9D8B7 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Jam3Q9D8B7 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Jam3Q9D8B7 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Jam3Q9D8B7 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Jam3Q9D8B7 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Jam3Q9D8B7 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Jam3Q9D8B7 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Jam3Q9D8B7 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Jam3Q9D8B7 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Jam3Q9D8B7 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Jam3Q9D8B7 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Jam3Q9D8B7 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Jam3Q9D8B7 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Jam3Q9D8B7 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Jam3Q9D8B7 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Jam3Q9D8B7 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Jam3Q9D8B7 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Jam3Q9D8B7 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Jam3Q9D8B7 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Jam3Q9D8B7 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Jam3Q9D8B7 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Jam3Q9D8B7 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Jam3Q9D8B7 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Jam3Q9D8B7 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Jam3Q9D8B7 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Jam3Q9D8B7 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Jam3Q9D8B7 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Jam3Q9D8B7 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Jam3Q9D8B7 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Jam3Q9D8B7 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Jam3Q9D8B7 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Jam3Q9D8B7 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Jam3Q9D8B7 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Jam3Q9D8B7 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Jam3Q9D8B7 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Jam3Q9D8B7 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Jam3Q9D8B7 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Jam3Q9D8B7 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Jam3Q9D8B7 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Jam3Q9D8B7 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Jam3Q9D8B7 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Jam3Q9D8B7 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Jam3Q9D8B7 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Jam3Q9D8B7 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Jam3Q9D8B7 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Jam3Q9D8B7 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Jam3Q9D8B7 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Jam3Q9D8B7 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Jam3Q9D8B7 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Jam3Q9D8B7 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Jam3Q9D8B7 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Jam3Q9D8B7 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Jam3Q9D8B7 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Jam3Q9D8B7 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Jam3Q9D8B7 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Jam3Q9D8B7 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Jam3Q9D8B7 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Jam3Q9D8B7 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
Jam3Q9D8B7 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Jam3Q9D8B7 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Jam3Q9D8B7 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Jam3Q9D8B7 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Jam3Q9D8B7 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Jam3Q9D8B7 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Jam3Q9D8B7 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Jam3Q9D8B7 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Jam3Q9D8B7 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Jam3Q9D8B7 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Jam3Q9D8B7 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Jam3Q9D8B7 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Jam3Q9D8B7 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Jam3Q9D8B7 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Jam3Q9D8B7 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Jam3Q9D8B7 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Jam3Q9D8B7 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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