Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7S1

Tmem54, Transmembrane protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem54Q9D7S1 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmem54Q9D7S1 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmem54Q9D7S1 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmem54Q9D7S1 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmem54Q9D7S1 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmem54Q9D7S1 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmem54Q9D7S1 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmem54Q9D7S1 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmem54Q9D7S1 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmem54Q9D7S1 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmem54Q9D7S1 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmem54Q9D7S1 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmem54Q9D7S1 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmem54Q9D7S1 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmem54Q9D7S1 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmem54Q9D7S1 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmem54Q9D7S1 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmem54Q9D7S1 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmem54Q9D7S1 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmem54Q9D7S1 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmem54Q9D7S1 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmem54Q9D7S1 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmem54Q9D7S1 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tmem54Q9D7S1 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem54Q9D7S1 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem54Q9D7S1 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem54Q9D7S1 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem54Q9D7S1 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem54Q9D7S1 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem54Q9D7S1 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem54Q9D7S1 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem54Q9D7S1 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem54Q9D7S1 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem54Q9D7S1 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem54Q9D7S1 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem54Q9D7S1 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem54Q9D7S1 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem54Q9D7S1 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem54Q9D7S1 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem54Q9D7S1 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem54Q9D7S1 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem54Q9D7S1 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem54Q9D7S1 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem54Q9D7S1 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem54Q9D7S1 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem54Q9D7S1 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem54Q9D7S1 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem54Q9D7S1 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Tmem54Q9D7S1 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem54Q9D7S1 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem54Q9D7S1 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem54Q9D7S1 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem54Q9D7S1 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem54Q9D7S1 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem54Q9D7S1 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem54Q9D7S1 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tmem54Q9D7S1 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmem54Q9D7S1 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmem54Q9D7S1 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmem54Q9D7S1 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmem54Q9D7S1 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmem54Q9D7S1 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmem54Q9D7S1 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmem54Q9D7S1 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmem54Q9D7S1 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmem54Q9D7S1 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmem54Q9D7S1 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmem54Q9D7S1 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmem54Q9D7S1 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmem54Q9D7S1 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmem54Q9D7S1 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmem54Q9D7S1 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmem54Q9D7S1 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmem54Q9D7S1 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmem54Q9D7S1 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmem54Q9D7S1 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmem54Q9D7S1 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmem54Q9D7S1 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmem54Q9D7S1 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmem54Q9D7S1 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmem54Q9D7S1 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmem54Q9D7S1 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmem54Q9D7S1 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmem54Q9D7S1 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmem54Q9D7S1 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmem54Q9D7S1 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmem54Q9D7S1 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmem54Q9D7S1 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmem54Q9D7S1 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmem54Q9D7S1 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmem54Q9D7S1 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmem54Q9D7S1 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmem54Q9D7S1 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tmem54Q9D7S1 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
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Tmem54Q9D7S1 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tmem54Q9D7S1 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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