Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J3

Ccdc94, Coiled-coil domain-containing protein 94, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc94Q9D6J3 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc94Q9D6J3 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc94Q9D6J3 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc94Q9D6J3 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc94Q9D6J3 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc94Q9D6J3 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc94Q9D6J3 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc94Q9D6J3 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc94Q9D6J3 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc94Q9D6J3 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc94Q9D6J3 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc94Q9D6J3 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc94Q9D6J3 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc94Q9D6J3 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc94Q9D6J3 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc94Q9D6J3 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc94Q9D6J3 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc94Q9D6J3 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc94Q9D6J3 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc94Q9D6J3 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc94Q9D6J3 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc94Q9D6J3 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc94Q9D6J3 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc94Q9D6J3 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc94Q9D6J3 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc94Q9D6J3 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc94Q9D6J3 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc94Q9D6J3 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc94Q9D6J3 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc94Q9D6J3 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc94Q9D6J3 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc94Q9D6J3 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc94Q9D6J3 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc94Q9D6J3 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc94Q9D6J3 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc94Q9D6J3 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc94Q9D6J3 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc94Q9D6J3 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc94Q9D6J3 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc94Q9D6J3 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc94Q9D6J3 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc94Q9D6J3 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc94Q9D6J3 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc94Q9D6J3 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc94Q9D6J3 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc94Q9D6J3 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc94Q9D6J3 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc94Q9D6J3 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc94Q9D6J3 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc94Q9D6J3 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc94Q9D6J3 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc94Q9D6J3 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc94Q9D6J3 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc94Q9D6J3 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc94Q9D6J3 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc94Q9D6J3 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc94Q9D6J3 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc94Q9D6J3 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc94Q9D6J3 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc94Q9D6J3 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc94Q9D6J3 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc94Q9D6J3 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc94Q9D6J3 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc94Q9D6J3 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc94Q9D6J3 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc94Q9D6J3 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc94Q9D6J3 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc94Q9D6J3 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc94Q9D6J3 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc94Q9D6J3 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc94Q9D6J3 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc94Q9D6J3 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc94Q9D6J3 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc94Q9D6J3 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc94Q9D6J3 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc94Q9D6J3 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc94Q9D6J3 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc94Q9D6J3 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc94Q9D6J3 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc94Q9D6J3 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc94Q9D6J3 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc94Q9D6J3 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc94Q9D6J3 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc94Q9D6J3 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc94Q9D6J3 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc94Q9D6J3 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc94Q9D6J3 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc94Q9D6J3 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc94Q9D6J3 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc94Q9D6J3 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc94Q9D6J3 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc94Q9D6J3 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc94Q9D6J3 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc94Q9D6J3 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc94Q9D6J3 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc94Q9D6J3 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc94Q9D6J3 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc94Q9D6J3 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc94Q9D6J3 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc94Q9D6J3 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms