Protein–RNA interactions for Protein: Q9D548

Zcchc13, Cellular nucleic acid binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc13Q9D548 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC9.46□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Zcchc13Q9D548 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Zcchc13Q9D548 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Zcchc13Q9D548 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Zcchc13Q9D548 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Zcchc13Q9D548 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Zcchc13Q9D548 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Zcchc13Q9D548 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Zcchc13Q9D548 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Zcchc13Q9D548 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Zcchc13Q9D548 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Zcchc13Q9D548 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Zcchc13Q9D548 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Zcchc13Q9D548 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Zcchc13Q9D548 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Zcchc13Q9D548 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Zcchc13Q9D548 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Zcchc13Q9D548 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Zcchc13Q9D548 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Zcchc13Q9D548 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Zcchc13Q9D548 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Zcchc13Q9D548 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Zcchc13Q9D548 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Zcchc13Q9D548 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms