Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V3

Ccdc83, Coiled-coil domain-containing protein 83, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc83Q9D4V3 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc83Q9D4V3 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc83Q9D4V3 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc83Q9D4V3 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc83Q9D4V3 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc83Q9D4V3 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc83Q9D4V3 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc83Q9D4V3 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc83Q9D4V3 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc83Q9D4V3 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc83Q9D4V3 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc83Q9D4V3 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc83Q9D4V3 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc83Q9D4V3 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc83Q9D4V3 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc83Q9D4V3 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc83Q9D4V3 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc83Q9D4V3 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc83Q9D4V3 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc83Q9D4V3 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc83Q9D4V3 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc83Q9D4V3 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc83Q9D4V3 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc83Q9D4V3 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc83Q9D4V3 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc83Q9D4V3 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc83Q9D4V3 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc83Q9D4V3 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc83Q9D4V3 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc83Q9D4V3 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc83Q9D4V3 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc83Q9D4V3 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc83Q9D4V3 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc83Q9D4V3 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc83Q9D4V3 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc83Q9D4V3 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc83Q9D4V3 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc83Q9D4V3 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc83Q9D4V3 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc83Q9D4V3 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc83Q9D4V3 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc83Q9D4V3 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc83Q9D4V3 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc83Q9D4V3 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc83Q9D4V3 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc83Q9D4V3 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc83Q9D4V3 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc83Q9D4V3 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc83Q9D4V3 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc83Q9D4V3 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc83Q9D4V3 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc83Q9D4V3 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc83Q9D4V3 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc83Q9D4V3 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc83Q9D4V3 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc83Q9D4V3 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc83Q9D4V3 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc83Q9D4V3 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc83Q9D4V3 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc83Q9D4V3 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc83Q9D4V3 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc83Q9D4V3 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc83Q9D4V3 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc83Q9D4V3 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc83Q9D4V3 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc83Q9D4V3 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc83Q9D4V3 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc83Q9D4V3 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc83Q9D4V3 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc83Q9D4V3 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc83Q9D4V3 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc83Q9D4V3 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc83Q9D4V3 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc83Q9D4V3 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc83Q9D4V3 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc83Q9D4V3 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc83Q9D4V3 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc83Q9D4V3 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc83Q9D4V3 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc83Q9D4V3 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc83Q9D4V3 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc83Q9D4V3 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc83Q9D4V3 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc83Q9D4V3 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc83Q9D4V3 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc83Q9D4V3 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc83Q9D4V3 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc83Q9D4V3 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc83Q9D4V3 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc83Q9D4V3 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc83Q9D4V3 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc83Q9D4V3 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc83Q9D4V3 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc83Q9D4V3 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc83Q9D4V3 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc83Q9D4V3 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc83Q9D4V3 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc83Q9D4V3 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc83Q9D4V3 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc83Q9D4V3 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms