Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4C6

Lrp2bp, LRP2-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrp2bpQ9D4C6 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrp2bpQ9D4C6 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrp2bpQ9D4C6 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrp2bpQ9D4C6 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrp2bpQ9D4C6 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrp2bpQ9D4C6 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrp2bpQ9D4C6 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrp2bpQ9D4C6 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrp2bpQ9D4C6 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrp2bpQ9D4C6 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrp2bpQ9D4C6 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrp2bpQ9D4C6 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrp2bpQ9D4C6 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrp2bpQ9D4C6 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrp2bpQ9D4C6 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrp2bpQ9D4C6 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrp2bpQ9D4C6 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrp2bpQ9D4C6 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrp2bpQ9D4C6 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrp2bpQ9D4C6 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrp2bpQ9D4C6 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrp2bpQ9D4C6 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrp2bpQ9D4C6 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrp2bpQ9D4C6 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrp2bpQ9D4C6 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrp2bpQ9D4C6 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrp2bpQ9D4C6 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrp2bpQ9D4C6 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrp2bpQ9D4C6 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrp2bpQ9D4C6 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrp2bpQ9D4C6 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrp2bpQ9D4C6 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrp2bpQ9D4C6 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrp2bpQ9D4C6 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrp2bpQ9D4C6 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrp2bpQ9D4C6 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrp2bpQ9D4C6 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrp2bpQ9D4C6 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrp2bpQ9D4C6 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrp2bpQ9D4C6 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrp2bpQ9D4C6 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrp2bpQ9D4C6 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrp2bpQ9D4C6 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrp2bpQ9D4C6 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrp2bpQ9D4C6 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrp2bpQ9D4C6 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrp2bpQ9D4C6 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrp2bpQ9D4C6 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrp2bpQ9D4C6 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrp2bpQ9D4C6 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrp2bpQ9D4C6 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrp2bpQ9D4C6 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrp2bpQ9D4C6 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrp2bpQ9D4C6 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrp2bpQ9D4C6 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrp2bpQ9D4C6 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrp2bpQ9D4C6 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrp2bpQ9D4C6 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrp2bpQ9D4C6 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrp2bpQ9D4C6 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrp2bpQ9D4C6 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrp2bpQ9D4C6 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrp2bpQ9D4C6 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrp2bpQ9D4C6 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrp2bpQ9D4C6 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrp2bpQ9D4C6 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrp2bpQ9D4C6 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrp2bpQ9D4C6 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrp2bpQ9D4C6 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrp2bpQ9D4C6 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrp2bpQ9D4C6 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrp2bpQ9D4C6 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrp2bpQ9D4C6 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrp2bpQ9D4C6 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrp2bpQ9D4C6 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrp2bpQ9D4C6 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrp2bpQ9D4C6 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrp2bpQ9D4C6 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrp2bpQ9D4C6 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrp2bpQ9D4C6 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrp2bpQ9D4C6 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrp2bpQ9D4C6 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrp2bpQ9D4C6 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrp2bpQ9D4C6 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrp2bpQ9D4C6 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrp2bpQ9D4C6 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrp2bpQ9D4C6 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrp2bpQ9D4C6 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrp2bpQ9D4C6 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrp2bpQ9D4C6 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrp2bpQ9D4C6 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrp2bpQ9D4C6 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrp2bpQ9D4C6 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrp2bpQ9D4C6 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrp2bpQ9D4C6 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrp2bpQ9D4C6 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrp2bpQ9D4C6 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrp2bpQ9D4C6 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrp2bpQ9D4C6 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrp2bpQ9D4C6 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms