Protein–RNA interactions for Protein: Q9D300

Rasgef1c, Ras-GEF domain-containing family member 1C, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasgef1cQ9D300 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rasgef1cQ9D300 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rasgef1cQ9D300 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rasgef1cQ9D300 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rasgef1cQ9D300 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rasgef1cQ9D300 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rasgef1cQ9D300 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rasgef1cQ9D300 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rasgef1cQ9D300 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rasgef1cQ9D300 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rasgef1cQ9D300 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rasgef1cQ9D300 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rasgef1cQ9D300 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rasgef1cQ9D300 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rasgef1cQ9D300 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rasgef1cQ9D300 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rasgef1cQ9D300 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rasgef1cQ9D300 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rasgef1cQ9D300 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rasgef1cQ9D300 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rasgef1cQ9D300 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rasgef1cQ9D300 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rasgef1cQ9D300 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rasgef1cQ9D300 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rasgef1cQ9D300 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rasgef1cQ9D300 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rasgef1cQ9D300 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rasgef1cQ9D300 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rasgef1cQ9D300 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rasgef1cQ9D300 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rasgef1cQ9D300 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rasgef1cQ9D300 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rasgef1cQ9D300 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rasgef1cQ9D300 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rasgef1cQ9D300 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rasgef1cQ9D300 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rasgef1cQ9D300 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rasgef1cQ9D300 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rasgef1cQ9D300 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rasgef1cQ9D300 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rasgef1cQ9D300 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rasgef1cQ9D300 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rasgef1cQ9D300 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rasgef1cQ9D300 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rasgef1cQ9D300 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rasgef1cQ9D300 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rasgef1cQ9D300 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rasgef1cQ9D300 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rasgef1cQ9D300 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rasgef1cQ9D300 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rasgef1cQ9D300 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rasgef1cQ9D300 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rasgef1cQ9D300 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rasgef1cQ9D300 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rasgef1cQ9D300 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rasgef1cQ9D300 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rasgef1cQ9D300 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rasgef1cQ9D300 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rasgef1cQ9D300 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rasgef1cQ9D300 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rasgef1cQ9D300 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rasgef1cQ9D300 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rasgef1cQ9D300 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rasgef1cQ9D300 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rasgef1cQ9D300 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rasgef1cQ9D300 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rasgef1cQ9D300 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rasgef1cQ9D300 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rasgef1cQ9D300 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rasgef1cQ9D300 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rasgef1cQ9D300 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rasgef1cQ9D300 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rasgef1cQ9D300 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rasgef1cQ9D300 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rasgef1cQ9D300 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rasgef1cQ9D300 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rasgef1cQ9D300 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rasgef1cQ9D300 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rasgef1cQ9D300 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rasgef1cQ9D300 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rasgef1cQ9D300 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rasgef1cQ9D300 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rasgef1cQ9D300 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rasgef1cQ9D300 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rasgef1cQ9D300 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rasgef1cQ9D300 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rasgef1cQ9D300 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rasgef1cQ9D300 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rasgef1cQ9D300 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rasgef1cQ9D300 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rasgef1cQ9D300 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rasgef1cQ9D300 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rasgef1cQ9D300 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rasgef1cQ9D300 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rasgef1cQ9D300 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rasgef1cQ9D300 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rasgef1cQ9D300 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rasgef1cQ9D300 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rasgef1cQ9D300 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rasgef1cQ9D300 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.5 ms