Protein–RNA interactions for Protein: Q9D232

Spns3, Protein spinster homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spns3Q9D232 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Spns3Q9D232 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Spns3Q9D232 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Spns3Q9D232 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Spns3Q9D232 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Spns3Q9D232 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Spns3Q9D232 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Spns3Q9D232 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Spns3Q9D232 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Spns3Q9D232 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Spns3Q9D232 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Spns3Q9D232 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Spns3Q9D232 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Spns3Q9D232 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Spns3Q9D232 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Spns3Q9D232 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Spns3Q9D232 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Spns3Q9D232 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Spns3Q9D232 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Spns3Q9D232 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Spns3Q9D232 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Spns3Q9D232 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Spns3Q9D232 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Spns3Q9D232 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Spns3Q9D232 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Spns3Q9D232 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Spns3Q9D232 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Spns3Q9D232 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Spns3Q9D232 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Spns3Q9D232 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Spns3Q9D232 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Spns3Q9D232 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Spns3Q9D232 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Spns3Q9D232 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Spns3Q9D232 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Spns3Q9D232 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Spns3Q9D232 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Spns3Q9D232 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Spns3Q9D232 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Spns3Q9D232 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Spns3Q9D232 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Spns3Q9D232 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Spns3Q9D232 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Spns3Q9D232 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Spns3Q9D232 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Spns3Q9D232 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Spns3Q9D232 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Spns3Q9D232 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Spns3Q9D232 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Spns3Q9D232 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Spns3Q9D232 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Spns3Q9D232 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Spns3Q9D232 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Spns3Q9D232 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Spns3Q9D232 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Spns3Q9D232 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Spns3Q9D232 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Spns3Q9D232 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Spns3Q9D232 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Spns3Q9D232 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Spns3Q9D232 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Spns3Q9D232 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Spns3Q9D232 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Spns3Q9D232 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Spns3Q9D232 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Spns3Q9D232 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Spns3Q9D232 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Spns3Q9D232 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Spns3Q9D232 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Spns3Q9D232 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Spns3Q9D232 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Spns3Q9D232 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Spns3Q9D232 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Spns3Q9D232 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Spns3Q9D232 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Spns3Q9D232 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Spns3Q9D232 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Spns3Q9D232 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Spns3Q9D232 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Spns3Q9D232 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Spns3Q9D232 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Spns3Q9D232 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Spns3Q9D232 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Spns3Q9D232 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Spns3Q9D232 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Spns3Q9D232 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Spns3Q9D232 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Spns3Q9D232 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Spns3Q9D232 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Spns3Q9D232 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Spns3Q9D232 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Spns3Q9D232 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Spns3Q9D232 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Spns3Q9D232 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Spns3Q9D232 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Spns3Q9D232 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Spns3Q9D232 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Spns3Q9D232 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Spns3Q9D232 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Spns3Q9D232 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms