Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1P4

Chordc1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chordc1Q9D1P4 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Chordc1Q9D1P4 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Chordc1Q9D1P4 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chordc1Q9D1P4 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chordc1Q9D1P4 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chordc1Q9D1P4 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chordc1Q9D1P4 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Chordc1Q9D1P4 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chordc1Q9D1P4 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chordc1Q9D1P4 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chordc1Q9D1P4 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chordc1Q9D1P4 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Chordc1Q9D1P4 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chordc1Q9D1P4 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chordc1Q9D1P4 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chordc1Q9D1P4 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chordc1Q9D1P4 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chordc1Q9D1P4 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chordc1Q9D1P4 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chordc1Q9D1P4 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chordc1Q9D1P4 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chordc1Q9D1P4 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chordc1Q9D1P4 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Chordc1Q9D1P4 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chordc1Q9D1P4 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chordc1Q9D1P4 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chordc1Q9D1P4 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chordc1Q9D1P4 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chordc1Q9D1P4 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chordc1Q9D1P4 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chordc1Q9D1P4 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Chordc1Q9D1P4 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chordc1Q9D1P4 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chordc1Q9D1P4 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chordc1Q9D1P4 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chordc1Q9D1P4 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chordc1Q9D1P4 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chordc1Q9D1P4 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chordc1Q9D1P4 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chordc1Q9D1P4 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chordc1Q9D1P4 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chordc1Q9D1P4 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chordc1Q9D1P4 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chordc1Q9D1P4 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chordc1Q9D1P4 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Chordc1Q9D1P4 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Chordc1Q9D1P4 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Chordc1Q9D1P4 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Chordc1Q9D1P4 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Chordc1Q9D1P4 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Chordc1Q9D1P4 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Chordc1Q9D1P4 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Chordc1Q9D1P4 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Chordc1Q9D1P4 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Chordc1Q9D1P4 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chordc1Q9D1P4 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chordc1Q9D1P4 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chordc1Q9D1P4 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chordc1Q9D1P4 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chordc1Q9D1P4 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Chordc1Q9D1P4 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chordc1Q9D1P4 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chordc1Q9D1P4 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chordc1Q9D1P4 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chordc1Q9D1P4 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chordc1Q9D1P4 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chordc1Q9D1P4 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chordc1Q9D1P4 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chordc1Q9D1P4 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chordc1Q9D1P4 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chordc1Q9D1P4 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chordc1Q9D1P4 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chordc1Q9D1P4 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chordc1Q9D1P4 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chordc1Q9D1P4 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chordc1Q9D1P4 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Chordc1Q9D1P4 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chordc1Q9D1P4 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chordc1Q9D1P4 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chordc1Q9D1P4 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chordc1Q9D1P4 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Chordc1Q9D1P4 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chordc1Q9D1P4 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Chordc1Q9D1P4 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chordc1Q9D1P4 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chordc1Q9D1P4 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chordc1Q9D1P4 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chordc1Q9D1P4 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chordc1Q9D1P4 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chordc1Q9D1P4 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chordc1Q9D1P4 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chordc1Q9D1P4 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Chordc1Q9D1P4 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Chordc1Q9D1P4 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Chordc1Q9D1P4 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Chordc1Q9D1P4 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Chordc1Q9D1P4 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Chordc1Q9D1P4 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Chordc1Q9D1P4 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Chordc1Q9D1P4 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms